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目的:研究云南汉族人群CCR5基因启动子单核苷酸多态性位点 (SNPs) 与丙型肝炎病毒 (HCV) 慢性感染的关系.方法:选取356例云南汉族HCV慢性感染者作为病例组, 353例健康体检者作为对照组, 采用PCR法扩增受检者CCR5基因启动子区基因序列;然后采用Sanger法对扩增序列进行测序并与Gen Bank (NC_000003.12) 序列比较获得与云南省汉族人群具有多态性的SNPs位点, 对获得的SNPs位点进行基因分型, 计算这些SNPs位点的等位基因频率和基因型频率;构建单倍型并分析遗传模式进行, 比较两组间的分布差异.结果:在CCR5基因启动子区域有9个SNPs位点, 其中rs2227010 (A>G) 、rs2734648 (T>G) 、rs1799987 (G>A) 、rs1799988 (T>C) 、rs1800023 (G>A) 及1800024 (C>T) 6个位点在云南省汉族人群中具有多态性;这6个SNPs位点的基因型频率、等位基因频率及单倍型频率在病例组与对照组比较, 差异均无统计学意义 (P>0.05) .结论:CCR5基因启动子中的rs2227010 (A>G) 、rs2734648 (T>G) 、rs1799987 (G>A) 、rs1799988 (T>C) 、rs1800023 (G>A) 及1800024 (C>T) SNPs位点与云南汉族人群HCV慢性感染无关.

作者:陈珺;刘舒媛;聂磊;朱永玉;李传印;刘楠楠;周紫云;史荔;张淑琼

来源:贵州医科大学学报 2019 年 44卷 1期

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作者:
陈珺;刘舒媛;聂磊;朱永玉;李传印;刘楠楠;周紫云;史荔;张淑琼
来源:
贵州医科大学学报 2019 年 44卷 1期
标签:
基因 多态性,单核苷酸 肝炎,丙型 CCR5 肝炎病毒 慢性感染 云南 汉族 gene polymorphism,single nucleotide hepatitis C CCR5 hepatitis virus sexual infection Yunnan,Han population
目的:研究云南汉族人群CCR5基因启动子单核苷酸多态性位点 (SNPs) 与丙型肝炎病毒 (HCV) 慢性感染的关系.方法:选取356例云南汉族HCV慢性感染者作为病例组, 353例健康体检者作为对照组, 采用PCR法扩增受检者CCR5基因启动子区基因序列;然后采用Sanger法对扩增序列进行测序并与Gen Bank (NC_000003.12) 序列比较获得与云南省汉族人群具有多态性的SNPs位点, 对获得的SNPs位点进行基因分型, 计算这些SNPs位点的等位基因频率和基因型频率;构建单倍型并分析遗传模式进行, 比较两组间的分布差异.结果:在CCR5基因启动子区域有9个SNPs位点, 其中rs2227010 (A>G) 、rs2734648 (T>G) 、rs1799987 (G>A) 、rs1799988 (T>C) 、rs1800023 (G>A) 及1800024 (C>T) 6个位点在云南省汉族人群中具有多态性;这6个SNPs位点的基因型频率、等位基因频率及单倍型频率在病例组与对照组比较, 差异均无统计学意义 (P>0.05) .结论:CCR5基因启动子中的rs2227010 (A>G) 、rs2734648 (T>G) 、rs1799987 (G>A) 、rs1799988 (T>C) 、rs1800023 (G>A) 及1800024 (C>T) SNPs位点与云南汉族人群HCV慢性感染无关.