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目的:分析单核细胞(Mo)向巨噬细胞(Mφ)分化的过程中,细胞骨架的调控相关基因及信号通路的表达变化.方法:CEO数据库获得Mo和Mφ的芯片数据,经RStudio软件分析获得差异表达基因(DEGenes),利用STRING在线工具对DEGenes构建蛋白质相互作用网络(PPI),Cytoscap软件筛选出DEGenes的核心模块;对筛选出的DEGenes的核心模块进行GO和KEGG分析.结果:Mφ相对于Mo的差异表达基因共476个,主要涉及的信号通路包括NOD样受体信号通路和吞噬体信号通路,这些通路中CCL18、CXCL8和C3等相关基因与细胞骨架的调控密切相关.结论:Mo向Mφ分化过程中细胞骨架调控相关基因的表达发生了显著改变.

作者:宋咏刚;胡文慧;余鹏;石玉玲;赵雪;胡祖权;王赟;曾柱

来源:贵州医科大学学报 2019 年 44卷 12期

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作者:
宋咏刚;胡文慧;余鹏;石玉玲;赵雪;胡祖权;王赟;曾柱
来源:
贵州医科大学学报 2019 年 44卷 12期
标签:
巨噬细胞 单核细胞 细胞骨架 生物信息学 基因芯片
目的:分析单核细胞(Mo)向巨噬细胞(Mφ)分化的过程中,细胞骨架的调控相关基因及信号通路的表达变化.方法:CEO数据库获得Mo和Mφ的芯片数据,经RStudio软件分析获得差异表达基因(DEGenes),利用STRING在线工具对DEGenes构建蛋白质相互作用网络(PPI),Cytoscap软件筛选出DEGenes的核心模块;对筛选出的DEGenes的核心模块进行GO和KEGG分析.结果:Mφ相对于Mo的差异表达基因共476个,主要涉及的信号通路包括NOD样受体信号通路和吞噬体信号通路,这些通路中CCL18、CXCL8和C3等相关基因与细胞骨架的调控密切相关.结论:Mo向Mφ分化过程中细胞骨架调控相关基因的表达发生了显著改变.