您的账号已在其他设备登录,您当前账号已强迫下线,
如非您本人操作,建议您在会员中心进行密码修改

确定
收藏 | 浏览140 | 下载45

目的 运用生物信息学方法筛选出新的肝细胞癌(HCC)预后生物标志物.方法 通过GEO2R筛选GSE14520数据集中的差异表达基因(DEG),利用STRING构建蛋白互作网络(PPI),Cytoscape软件筛选出关键基因.DAVID进行GO和KEGG分析,然后使用GEPIA分析关键基因在HCC中的表达以及与预后的关系.结果 GSE14520数据集共筛选出348个差异表达基因,其中91个上调基因,257个下调基因.从PPI中筛选出排列最前的2个网络模块:模块1和模块2.两个模块中位于网络中心区域的关键基因共46个.关键基因显著富集于细胞周期、DNA复制药物代谢等信号通路.GEPIA验证显示关键基因中的PROZ和F9在HCC患者中显著低表达,并与患者总体生存率及无病生存率降低相关.结论 PROZ和F9可作为HCC的潜在预后生物标志物.

作者:何春梅;莫之婧

来源:肝脏 2021 年 26卷 5期

知识库介绍

临床诊疗知识库该平台旨在解决临床医护人员在学习、工作中对医学信息的需求,方便快速、便捷的获取实用的医学信息,辅助临床决策参考。该库包含疾病、药品、检查、指南规范、病例文献及循证文献等多种丰富权威的临床资源。

详细介绍
热门关注
免责声明:本知识库提供的有关内容等信息仅供学习参考,不代替医生的诊断和医嘱。

收藏
| 浏览:140 | 下载:45
作者:
何春梅;莫之婧
来源:
肝脏 2021 年 26卷 5期
标签:
肝细胞癌 DEGs 生物信息学分析
目的 运用生物信息学方法筛选出新的肝细胞癌(HCC)预后生物标志物.方法 通过GEO2R筛选GSE14520数据集中的差异表达基因(DEG),利用STRING构建蛋白互作网络(PPI),Cytoscape软件筛选出关键基因.DAVID进行GO和KEGG分析,然后使用GEPIA分析关键基因在HCC中的表达以及与预后的关系.结果 GSE14520数据集共筛选出348个差异表达基因,其中91个上调基因,257个下调基因.从PPI中筛选出排列最前的2个网络模块:模块1和模块2.两个模块中位于网络中心区域的关键基因共46个.关键基因显著富集于细胞周期、DNA复制药物代谢等信号通路.GEPIA验证显示关键基因中的PROZ和F9在HCC患者中显著低表达,并与患者总体生存率及无病生存率降低相关.结论 PROZ和F9可作为HCC的潜在预后生物标志物.