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目的::采用生物信息学和系统生物学途径,研究白藜芦醇的抗肺腺癌作用机制。方法:从GEO数据库获取白藜芦醇处理肺腺癌的表达谱数据集( No:GSE9008),经质量分析和标化后,采用dchip软件筛选差异表达基因;采用GO注释工具对差异基因进行生物过程注释;采用Toppgene工具对差异基因进行信号通路富集分析;通过CMAP进行药物作用机制或药理作用预测分析。结果:对比白藜芦醇和乙醇作用于A549细胞的表达谱,获得116个显著差异表达基因,其中上调基因92个,下调基因24个;差异表达基因主要涉及细胞凋亡、黏附等生物学过程;白藜芦醇可能通过调节p53、DNA损伤修复、细胞外基质( ECM)糖酵解过程等信号通路而发挥抗肺腺癌作用;CMAP 分析显示,白藜芦醇的抗肺腺癌作用与类雌激素或激素作用、抗炎作用、抑制微生物生长、Hsp90抑制作用等相关。结论:白藜芦醇的抗肺腺癌作用机制复杂,可能与其具有的抗炎、抗微生物、雌激素或激素效应等有关。

作者:王桂平;叶云;钟英英;李智斌;张彦焘

来源:广州医科大学学报 2016 年 44卷 2期

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作者:
王桂平;叶云;钟英英;李智斌;张彦焘
来源:
广州医科大学学报 2016 年 44卷 2期
标签:
白藜芦醇 肺肿瘤 腺癌 系统生物学 基因表达谱 Resveratrol lung neoplasms adenocarcinoma systems biology gene expression profile
目的::采用生物信息学和系统生物学途径,研究白藜芦醇的抗肺腺癌作用机制。方法:从GEO数据库获取白藜芦醇处理肺腺癌的表达谱数据集( No:GSE9008),经质量分析和标化后,采用dchip软件筛选差异表达基因;采用GO注释工具对差异基因进行生物过程注释;采用Toppgene工具对差异基因进行信号通路富集分析;通过CMAP进行药物作用机制或药理作用预测分析。结果:对比白藜芦醇和乙醇作用于A549细胞的表达谱,获得116个显著差异表达基因,其中上调基因92个,下调基因24个;差异表达基因主要涉及细胞凋亡、黏附等生物学过程;白藜芦醇可能通过调节p53、DNA损伤修复、细胞外基质( ECM)糖酵解过程等信号通路而发挥抗肺腺癌作用;CMAP 分析显示,白藜芦醇的抗肺腺癌作用与类雌激素或激素作用、抗炎作用、抑制微生物生长、Hsp90抑制作用等相关。结论:白藜芦醇的抗肺腺癌作用机制复杂,可能与其具有的抗炎、抗微生物、雌激素或激素效应等有关。