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目的 探索CLDN10在肾透明细胞癌(ccRCC)的表达及临床意义.方法 通过Oncomine数据库、Ualcan数据库、GEPIA数据库、HPA数据库、String-DB数据库、Metascape数据库分析CLDN10在正常肾组织与ccRCC中的表达差异、CLDN10表达水平与ccRCC患者临床特征的相关性及其对患者预后的影响、CLDN10在正常肾组织与ccRCC的甲基化水平差异、CLDN10与上下游蛋白的相互作用关系以及关联基因的富集通路.结果 CLDN10在ccRCC中的mRNA和蛋白质表达水平较正常肾组织低(P<0.05),利用Ualcan数据库分析发现CLDN10在正常肾组织与肿瘤分期(stage1、stage2、stage3和stage4)、ccRCC亚型(ccA和ccB)、淋巴结转移(N0和N1)的表达差异均为P<1E-12(P<0.05),且随着肿瘤分期的增高,CLDN10的表达呈下降趋势,其表达水平与肿瘤进展相关,CLDN10低表达患者生存率较高表达组明显降低(P<0.05).CLDN10在正常肾组织与stage1、stage2、stage3、stage4中的甲基化表达差异分别为P=1.62E-12、P=3.11E-08、P=1.62E-12、P=1.62E-12,以上差异均具有统计学意义(P<0.05).同时,与CLDN10蛋白相关的蛋白有CLDN14、CLDN2、CLDN16、CLDN8、CLDN3、CLDN1、CLDN19等,主要参与了增殖、分化、转移、细胞屏障、细胞紧密连接等生物过程.结论 通过挖掘分析肿瘤生物信息数据库发

作者:徐争光;李灿楦;李晓;林晏廷;陈洁

来源:海南医学 2021 年 32卷 20期

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作者:
徐争光;李灿楦;李晓;林晏廷;陈洁
来源:
海南医学 2021 年 32卷 20期
标签:
CLDN10;肾透明细胞癌;生物信息学;表达差异;预后
目的 探索CLDN10在肾透明细胞癌(ccRCC)的表达及临床意义.方法 通过Oncomine数据库、Ualcan数据库、GEPIA数据库、HPA数据库、String-DB数据库、Metascape数据库分析CLDN10在正常肾组织与ccRCC中的表达差异、CLDN10表达水平与ccRCC患者临床特征的相关性及其对患者预后的影响、CLDN10在正常肾组织与ccRCC的甲基化水平差异、CLDN10与上下游蛋白的相互作用关系以及关联基因的富集通路.结果 CLDN10在ccRCC中的mRNA和蛋白质表达水平较正常肾组织低(P<0.05),利用Ualcan数据库分析发现CLDN10在正常肾组织与肿瘤分期(stage1、stage2、stage3和stage4)、ccRCC亚型(ccA和ccB)、淋巴结转移(N0和N1)的表达差异均为P<1E-12(P<0.05),且随着肿瘤分期的增高,CLDN10的表达呈下降趋势,其表达水平与肿瘤进展相关,CLDN10低表达患者生存率较高表达组明显降低(P<0.05).CLDN10在正常肾组织与stage1、stage2、stage3、stage4中的甲基化表达差异分别为P=1.62E-12、P=3.11E-08、P=1.62E-12、P=1.62E-12,以上差异均具有统计学意义(P<0.05).同时,与CLDN10蛋白相关的蛋白有CLDN14、CLDN2、CLDN16、CLDN8、CLDN3、CLDN1、CLDN19等,主要参与了增殖、分化、转移、细胞屏障、细胞紧密连接等生物过程.结论 通过挖掘分析肿瘤生物信息数据库发