目的 采用网络药理学及分子对接技术探讨丹参治疗黄褐斑的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、UniProt数据库获得丹参的活性成分以及潜在靶点基因.应用GeneCards、DisGeNet数据库检索黄褐斑相关作用靶点.应用Venny2.1.0获得丹参治疗黄褐斑的作用靶点.将作用靶点导入STRING数据库构建蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络.应用DAVID数据库进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.运用CytoScape 3.8.2软件构建丹参治疗黄褐斑的成分-靶点-通路网络,并筛选核心靶点,利用PyMOL及AutoDock Vina软件,对重要化合物进行分子对接验证.结果 剔除无对应的靶基因信息后,筛选获得丹参有效活性成分58个,分子靶点105个,获得黄褐斑靶点基因51个.通过Venny处理获得7个共同靶点,分别为血管内皮生长因子A(VEGFA)、前列腺素G/H合酶2(PTGS2)、雌激素受体1(ESR1)、雌激素受体2(ESR2)、孕酮受体(PGR)、诱导型一氧化氮合酶2(NOS2)、酪氨酸酶(TYR).应用CytoScape 3.8.2软件中的CytoHubba插件,按照MCC(Maximal Clique Centrality)分析法,获得排名前4的关键基因,依次为VEGFA、PTGS2、ESR1、PGR.GO富集分析得到37个注释条目,包括19个生物过程(biological processes,BP)、2种
作者:郝丽娜;郝丽莎
来源:海南医学 2022 年 33卷 17期