目的 基于ESTIMATE评分筛选与肝癌肿瘤微环境预后相关的基因.方法 从TCGA数据库中下载肝癌转录组数据,使用ESTIMATE法计算肝癌组织的免疫和基质评分.分析肝癌基质、免疫评分与肿瘤分级、分期、生存时间的相关关系.Limma包分析差异表达基因,进行基因功能富集分析和通路富集分析.采用Cytoscape中Mcode模块筛选核心差异表达基因,并分析核心基因与肝癌预后、诊断和肿瘤免疫浸润细胞的相关关系.结果 筛选出肝癌微环境相关差异表达基因329个.基因功能富集分析显示其主要参与免疫激活和调节等过程.Cytoscape筛选PPI网络核心基因CCR5、SLAMF1、TRAF3IP3,在肝癌中高表达,且基因表达量高的患者的总生存期较低表达患者长,与肿瘤免疫浸润细胞比例呈正相关关系.结论 CCR5、SLAMF1、TRAF3IP3基因表达与肝癌的诊断、预后显著相关.
作者：黄佳怡；张文键；高蕾；刘玲珑
来源：海南医学 2023 年 34卷 16期
