您的账号已在其他设备登录,您当前账号已强迫下线,
如非您本人操作,建议您在会员中心进行密码修改

确定
收藏 | 浏览112 | 下载54

目的 探讨趋化因子受体4(CXCR4)对胃癌患者预后相关性及潜在机制.方法 从TCGA数据库下载胃癌患者的RNA表达及临床数据,按CXCR4表达水平分为高表达组(188例)和低表达组(187例),比较2组患者生存时间、不同肿瘤分期胃癌患者的CXCR4表达水平;将患者所测的各个RNA表达水平逐一与CXCR4表达水平进行Pearson相关性分析,选取相关性最高的前50个基因;对筛选出的50个基因进行GO富集分析、KEGG通路富集分析以及所编码的蛋白质之间的相互作用.结果 CXCR4高表达组胃癌患者中位生存时间低于CXCR4低表达组(P<0.01).病理分期Ⅰ期患者CXCR4表达水平显著低于Ⅱ~Ⅳ期,T1期患者CXCR4表达水平显著低于T2~T4期,M0期患者CXCR4表达水平低于M1期(均P<0.05);N分期4组间CXCR4表达水平比较差异无统计学意义(P>0.05).在检测的20225个基因中,有11623个基因与CXCR4存在相关性,选取与CXCR4表达相关系数最高的前50个基因,其中氢电压门控通道1和RCSD结构域1与CXCR4表达水平的相关系数最高(r=0.749、0.738,P<0.001).GO富集分析可见,主要涉及的生物学过程包括对刺激的反应、生物调节、细胞通讯,主要定位的细胞组分为膜、囊泡、细胞质,主要涉及的分子功能为蛋白质结合、分子换能器活动、酶调节剂活性.KEGG通路富集分析可见,主要涉及的信号通路

作者:张椿钰;侯世科;吴超;程明

来源:解放军医药杂志 2020 年 32卷 2期

知识库介绍

临床诊疗知识库该平台旨在解决临床医护人员在学习、工作中对医学信息的需求,方便快速、便捷的获取实用的医学信息,辅助临床决策参考。该库包含疾病、药品、检查、指南规范、病例文献及循证文献等多种丰富权威的临床资源。

详细介绍
热门关注
免责声明:本知识库提供的有关内容等信息仅供学习参考,不代替医生的诊断和医嘱。

收藏
| 浏览:112 | 下载:54
作者:
张椿钰;侯世科;吴超;程明
来源:
解放军医药杂志 2020 年 32卷 2期
标签:
胃肿瘤 趋化因子受体4 生物信息学 预后 蛋白酪氨酸激酶类 年龄因素
目的 探讨趋化因子受体4(CXCR4)对胃癌患者预后相关性及潜在机制.方法 从TCGA数据库下载胃癌患者的RNA表达及临床数据,按CXCR4表达水平分为高表达组(188例)和低表达组(187例),比较2组患者生存时间、不同肿瘤分期胃癌患者的CXCR4表达水平;将患者所测的各个RNA表达水平逐一与CXCR4表达水平进行Pearson相关性分析,选取相关性最高的前50个基因;对筛选出的50个基因进行GO富集分析、KEGG通路富集分析以及所编码的蛋白质之间的相互作用.结果 CXCR4高表达组胃癌患者中位生存时间低于CXCR4低表达组(P<0.01).病理分期Ⅰ期患者CXCR4表达水平显著低于Ⅱ~Ⅳ期,T1期患者CXCR4表达水平显著低于T2~T4期,M0期患者CXCR4表达水平低于M1期(均P<0.05);N分期4组间CXCR4表达水平比较差异无统计学意义(P>0.05).在检测的20225个基因中,有11623个基因与CXCR4存在相关性,选取与CXCR4表达相关系数最高的前50个基因,其中氢电压门控通道1和RCSD结构域1与CXCR4表达水平的相关系数最高(r=0.749、0.738,P<0.001).GO富集分析可见,主要涉及的生物学过程包括对刺激的反应、生物调节、细胞通讯,主要定位的细胞组分为膜、囊泡、细胞质,主要涉及的分子功能为蛋白质结合、分子换能器活动、酶调节剂活性.KEGG通路富集分析可见,主要涉及的信号通路