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背景:胃癌是常见的消化道肿瘤.脂肪酸在胃癌发展过程中起有重要作用.脂肪酸的功能需要脂肪酸结合蛋白(FABP)的参与.目的:系统分析FABP家族对胃癌发生风险和预后的影响并了解FABP家族的潜在功能.方法:利用ONCOMINE数据库分析胃癌与癌旁组织中FABP家族成员的mRNA差异表达,应用GEPIA数据库进行验证,并分析FABP家族成员与胃癌患者生存之间的关系.应用人类蛋白图谱数据库分析胃癌中FABP家族成员蛋白差异表达变化.应用STRING、DAVID数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用分析和GO、KEGG富集分析.结果:与正常胃组织相比,胃癌中FABP3/4/7表达明显下调,FABP1表达存在争议.生存分析结果显示,FABP3/4/8 mRNA低水平者的总体生存率高.GO分析显示FABP家族主要富集于生物过程、细胞质和分子功能变化.KEGG分析显示FABP家族主要参与PPAR信号通路、脂肪的消化与吸收信号通路.结论:FABP3/4/7可作为胃癌发生风险的标志物,FABP3/4/8可作为胃癌的预后标志物.FABP的作用可能与PPAR途径和脂质代谢途径有关.

作者:刘松意;宫月华;邢承忠

来源:胃肠病学 2020 年 25卷 12期

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作者:
刘松意;宫月华;邢承忠
来源:
胃肠病学 2020 年 25卷 12期
标签:
胃肿瘤 脂肪酸结合蛋白质类 生物信息学 预后
背景:胃癌是常见的消化道肿瘤.脂肪酸在胃癌发展过程中起有重要作用.脂肪酸的功能需要脂肪酸结合蛋白(FABP)的参与.目的:系统分析FABP家族对胃癌发生风险和预后的影响并了解FABP家族的潜在功能.方法:利用ONCOMINE数据库分析胃癌与癌旁组织中FABP家族成员的mRNA差异表达,应用GEPIA数据库进行验证,并分析FABP家族成员与胃癌患者生存之间的关系.应用人类蛋白图谱数据库分析胃癌中FABP家族成员蛋白差异表达变化.应用STRING、DAVID数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用分析和GO、KEGG富集分析.结果:与正常胃组织相比,胃癌中FABP3/4/7表达明显下调,FABP1表达存在争议.生存分析结果显示,FABP3/4/8 mRNA低水平者的总体生存率高.GO分析显示FABP家族主要富集于生物过程、细胞质和分子功能变化.KEGG分析显示FABP家族主要参与PPAR信号通路、脂肪的消化与吸收信号通路.结论:FABP3/4/7可作为胃癌发生风险的标志物,FABP3/4/8可作为胃癌的预后标志物.FABP的作用可能与PPAR途径和脂质代谢途径有关.