目的:了解柯萨奇病毒B5( CoxB5)河南分离株全基因特征及与其他肠道病毒基因的关系.方法:采用RT-PCR扩增全基因,采用DNAStar中的SeqMan拼接所测序列,BioEdit进行同源性比较,Simplot进行相似度分析.结果:CoxB5/Henan/2010基因组全长7 401 bp.与原型株Faulkner相比,编码区氨基酸同源性为95.6％,核苷酸同源性为79.9％,其中VP4-VP2核苷酸差异为17.8％～20.4％,VP1核苷酸差异为19.5％,P2、P3核苷酸差异分别为19.5％、21.7％.不同型别肠道病毒间VP4-VP2核苷酸差异为14.4％ ～ 34.9％,VP1核苷酸差异为18.3％～42.3％,P2、P3核苷酸差异为17.1％～21.0％、15.5％ ～ 22.6％.结论:与原型株相比,CoxB5/Henan/2010株编码区发生沉默突变,其核苷酸变异并不影响氨基酸序列的变化；肠道病毒基因组各分区在进化中不同步.
作者：黄学勇；许玉玲；李幸乐；晁灵；陈豪敏；许汴利
来源：郑州大学学报（医学版） 2011 年 46卷 6期
