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目的 分析引起江苏省疱疹性咽峡炎的柯萨奇病毒B组5型(coxsackievirus B5,CV-B5)毒株基因组特征.方法 对江苏省2013—2014年3例疱疹性咽峡炎患儿临床标本进行病原分离,获得3株CV-B5毒株,进行全基因组序列测定,与GenBank中世界各地不同年份CV-B5流行株序列进行比对分析,使用Mega 5.2软件构建系统进化树,并应用Simplot软件进行重组分析.结果 获得3株CV-B5毒株,分别命名为417/JS/CHN/2013、492/JS/CHN/2013和759/JS/CHN/2014,均属于GI.D3亚型,且在位点5224~5696 bp(以Faulkner为参考株)与2008年北京市的CV-B3流行株(GQ141875)发生重组,在位点5696 bp之后与2009年昆明市的CV-B3流行株(JX843810)发生重组.结论 CV-B5在婴幼儿人群中的感染可能存在严重危害,应加强对CV-B5的分子流行病学研究,监测可能发生的重组.

作者:卞莲莲;姚昕;高帆;孙世洋;毛群颖;杨晓明;梁争论

来源:微生物学免疫学进展 2019 年 47卷 2期

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作者:
卞莲莲;姚昕;高帆;孙世洋;毛群颖;杨晓明;梁争论
来源:
微生物学免疫学进展 2019 年 47卷 2期
标签:
柯萨奇病毒B组5型 基因组 重组 分析
目的 分析引起江苏省疱疹性咽峡炎的柯萨奇病毒B组5型(coxsackievirus B5,CV-B5)毒株基因组特征.方法 对江苏省2013—2014年3例疱疹性咽峡炎患儿临床标本进行病原分离,获得3株CV-B5毒株,进行全基因组序列测定,与GenBank中世界各地不同年份CV-B5流行株序列进行比对分析,使用Mega 5.2软件构建系统进化树,并应用Simplot软件进行重组分析.结果 获得3株CV-B5毒株,分别命名为417/JS/CHN/2013、492/JS/CHN/2013和759/JS/CHN/2014,均属于GI.D3亚型,且在位点5224~5696 bp(以Faulkner为参考株)与2008年北京市的CV-B3流行株(GQ141875)发生重组,在位点5696 bp之后与2009年昆明市的CV-B3流行株(JX843810)发生重组.结论 CV-B5在婴幼儿人群中的感染可能存在严重危害,应加强对CV-B5的分子流行病学研究,监测可能发生的重组.