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目的:预测结核分枝杆菌Rv1242蛋白的抗原表位.方法:利用DNAStar软件包中Protean软件对Rv1242氨基酸序列进行分析,采用包括二级结构、亲水性、抗原性、表面可能性、柔韧性等多参数预测其二级结构及T细胞和B细胞抗原表位.结果:Rv1242蛋白具有丰富的二级结构和多处抗原指数较高的区段,有7个亲水性区域,含有B细胞抗原肽表位(可能在17-38、72-82、84-90、116-130、134-143位氨基酸残基或其附近),这些表位抗原性较好,都含有β转角和不规则卷曲结构,表面可能性和柔韧性都较大.该蛋白还含有T细胞抗原肽表位(可能在24-33、42-59、68-77、90-108位氨基酸残基或其附近).结论:Rv1242蛋白可能是一个既有T细胞抗原表位、也有B细胞抗原表位的抗原,该研究为进一步研究该蛋白抗原表位及其应用奠定了基础.

作者:侯英;白雪娟;梁艳;吴雪琼

来源:郑州大学学报(医学版) 2016 年 51卷 3期

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作者:
侯英;白雪娟;梁艳;吴雪琼
来源:
郑州大学学报(医学版) 2016 年 51卷 3期
标签:
抗原表位 Rv1242蛋白 二级结构 结核分枝杆菌 epitope Rv1242 protein secondary structure Mycobacterium tuberculosis
目的:预测结核分枝杆菌Rv1242蛋白的抗原表位.方法:利用DNAStar软件包中Protean软件对Rv1242氨基酸序列进行分析,采用包括二级结构、亲水性、抗原性、表面可能性、柔韧性等多参数预测其二级结构及T细胞和B细胞抗原表位.结果:Rv1242蛋白具有丰富的二级结构和多处抗原指数较高的区段,有7个亲水性区域,含有B细胞抗原肽表位(可能在17-38、72-82、84-90、116-130、134-143位氨基酸残基或其附近),这些表位抗原性较好,都含有β转角和不规则卷曲结构,表面可能性和柔韧性都较大.该蛋白还含有T细胞抗原肽表位(可能在24-33、42-59、68-77、90-108位氨基酸残基或其附近).结论:Rv1242蛋白可能是一个既有T细胞抗原表位、也有B细胞抗原表位的抗原,该研究为进一步研究该蛋白抗原表位及其应用奠定了基础.