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目的 预测结核分枝杆菌Rv1419蛋白的抗原表位.方法 利用DNAStar软件包中Protean软件对Rv1419氨基酸序列进行分析,采用包括二级结构、亲水性、抗原性、可及性、柔韧性、电荷分布等多参数预测其二级结构及T细胞和B细胞抗原表位.结果 Rv1419蛋白具有丰富的二级结构和多处抗原指数较高的区段,含有少数潜在的B细胞抗原肽表位(可能在67~70、72~82、142~154、131~137位氨基酸残基或其附近),这些表位抗原性较好,都含有β转角和无规则卷曲结构,呈现在表面的可能性和柔韧性都较大.该蛋白含有较多潜在的T细胞抗原肽表位(可能在5~15、18~22、29~32、43~55、58~62、64~68、86~97、99~109、110~114、117~123,126~128、136~140位氨基酸残基或其附近).结论 结核分枝杆菌Rv1419蛋白是一个T细胞抗原表位占优势的蛋白抗原,也存在B细胞抗原表位,本研究结果为该蛋白抗原表位的进一步研究、应用奠定了基础.

作者:刘银萍;王全立;张俊仙;梁艳;阳幼荣;白雪娟;吴雪琼

来源:中国防痨杂志 2015 年 37卷 1期

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刘银萍;王全立;张俊仙;梁艳;阳幼荣;白雪娟;吴雪琼
来源:
中国防痨杂志 2015 年 37卷 1期
标签:
表位 细菌蛋白质类 蛋白质结构,二级 结核分枝杆菌 Epitopes Bacterial proteins Protein structure,secondary Mycobacterium tuberculosis
目的 预测结核分枝杆菌Rv1419蛋白的抗原表位.方法 利用DNAStar软件包中Protean软件对Rv1419氨基酸序列进行分析,采用包括二级结构、亲水性、抗原性、可及性、柔韧性、电荷分布等多参数预测其二级结构及T细胞和B细胞抗原表位.结果 Rv1419蛋白具有丰富的二级结构和多处抗原指数较高的区段,含有少数潜在的B细胞抗原肽表位(可能在67~70、72~82、142~154、131~137位氨基酸残基或其附近),这些表位抗原性较好,都含有β转角和无规则卷曲结构,呈现在表面的可能性和柔韧性都较大.该蛋白含有较多潜在的T细胞抗原肽表位(可能在5~15、18~22、29~32、43~55、58~62、64~68、86~97、99~109、110~114、117~123,126~128、136~140位氨基酸残基或其附近).结论 结核分枝杆菌Rv1419蛋白是一个T细胞抗原表位占优势的蛋白抗原,也存在B细胞抗原表位,本研究结果为该蛋白抗原表位的进一步研究、应用奠定了基础.