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目的:通过网络药理学和生物信息学方法探索黄精治疗糖尿病潜在的分子机制,为药食同源类中药治疗糖尿病的开发研究提供理论依据.方法:运用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选出黄精发挥治疗作用的活性成分,并检索黄精活性成分的效应靶点,Cytoscape构建黄精活性成分-靶点网络关系图.应用疾病数据库检索与糖尿病发生发展相关的疾病基因靶点.构建黄精活性成分靶点和疾病靶点的蛋白质交互作用关系网络.采用DAVID进行GO和KEGG通路富集分析,运用CytoHubba筛选出黄精治疗糖尿病的潜在关键靶点.结果:TCMSP筛选出黄精发挥治疗作用的活性入血成分12个,经配对分析得到黄精发挥治疗作用的活性成分6个,成分对应的基因靶点190个.运用疾病数据库检索到糖尿病相关疾病靶点基因134个.黄精治疗糖尿病的蛋白关系网络涉及的特征性基因靶点共101个,包含256个作用关系.GO富集分析显示生物学过程涉及细胞分裂、细胞基质黏附、细胞迁移等,分子功能涉及转录辅激活性、蛋白质结合、生长因子活性等;主要分布于细胞表面、细胞质、胞质溶胶、外泌体等位置发挥生理或病理作用.KEGG获得可能发挥作用的信号通路31条,这些信号通路集中在细胞周期、细胞信息传递、癌症信号分子及炎症、免疫应答等区域.CytoHubba工具进行拓扑进一步分

作者:何卫波;曾梅艳;宋厚盼;陈小娟;陈新怡;向茗;蔡雄;谢梦洲;黄惠勇

来源:中医学报 2019 年 34卷 10期

知识库介绍

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作者:
何卫波;曾梅艳;宋厚盼;陈小娟;陈新怡;向茗;蔡雄;谢梦洲;黄惠勇
来源:
中医学报 2019 年 34卷 10期
标签:
黄精 糖尿病 网络药理学 生物信息学 分子机制
目的:通过网络药理学和生物信息学方法探索黄精治疗糖尿病潜在的分子机制,为药食同源类中药治疗糖尿病的开发研究提供理论依据.方法:运用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选出黄精发挥治疗作用的活性成分,并检索黄精活性成分的效应靶点,Cytoscape构建黄精活性成分-靶点网络关系图.应用疾病数据库检索与糖尿病发生发展相关的疾病基因靶点.构建黄精活性成分靶点和疾病靶点的蛋白质交互作用关系网络.采用DAVID进行GO和KEGG通路富集分析,运用CytoHubba筛选出黄精治疗糖尿病的潜在关键靶点.结果:TCMSP筛选出黄精发挥治疗作用的活性入血成分12个,经配对分析得到黄精发挥治疗作用的活性成分6个,成分对应的基因靶点190个.运用疾病数据库检索到糖尿病相关疾病靶点基因134个.黄精治疗糖尿病的蛋白关系网络涉及的特征性基因靶点共101个,包含256个作用关系.GO富集分析显示生物学过程涉及细胞分裂、细胞基质黏附、细胞迁移等,分子功能涉及转录辅激活性、蛋白质结合、生长因子活性等;主要分布于细胞表面、细胞质、胞质溶胶、外泌体等位置发挥生理或病理作用.KEGG获得可能发挥作用的信号通路31条,这些信号通路集中在细胞周期、细胞信息传递、癌症信号分子及炎症、免疫应答等区域.CytoHubba工具进行拓扑进一步分