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目的:利用网络药理学理论结合高通量基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)数据分析木白散治疗消化性溃疡的作用机制.方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)数据库中搜索木白散药物活性成分筛选靶基因;以"Pepticulcer"为关键词在Genecards、OMIM以及GEO数据库中检索疾病相关基因;获取药物-疾病共同基因;利用R3.5.2软件对共同基因进行基因本体功能注释(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;绘制PPI蛋白互作网络并获取核心基因,利用GEO基因表达矩阵验证部分核心基因的差异表达结果.结果:木白散152个有效活性成分,335个靶点;消化性溃疡靶基因1 015个,药物-疾病共同基因92个,筛选出前列腺素G/H合酶2(prostaglandin G/H synthase 2,PTGS2)、白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6),IL-10、C-C 基序趋化因子 2(C-C motif chemokine ligand 2,CCL2)、胞间黏附分子 1(cell adhesion molecule 1,ICAM1)、血管细胞黏附蛋白 1(vascular cell adhesion molecule-1,VCAM1)、基质金属蛋白酶-9(matrix metalloproteinase-9,MMP-9)等 35 个核心基因,GE

作者:白童瑜;吴宿慧

来源:中医学报 2022 年 37卷 8期

知识库介绍

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作者:
白童瑜;吴宿慧
来源:
中医学报 2022 年 37卷 8期
标签:
木白散 消化性溃疡 网络药理学 GEO数据 作用机制
目的:利用网络药理学理论结合高通量基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)数据分析木白散治疗消化性溃疡的作用机制.方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)数据库中搜索木白散药物活性成分筛选靶基因;以"Pepticulcer"为关键词在Genecards、OMIM以及GEO数据库中检索疾病相关基因;获取药物-疾病共同基因;利用R3.5.2软件对共同基因进行基因本体功能注释(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;绘制PPI蛋白互作网络并获取核心基因,利用GEO基因表达矩阵验证部分核心基因的差异表达结果.结果:木白散152个有效活性成分,335个靶点;消化性溃疡靶基因1 015个,药物-疾病共同基因92个,筛选出前列腺素G/H合酶2(prostaglandin G/H synthase 2,PTGS2)、白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6),IL-10、C-C 基序趋化因子 2(C-C motif chemokine ligand 2,CCL2)、胞间黏附分子 1(cell adhesion molecule 1,ICAM1)、血管细胞黏附蛋白 1(vascular cell adhesion molecule-1,VCAM1)、基质金属蛋白酶-9(matrix metalloproteinase-9,MMP-9)等 35 个核心基因,GE