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目的 设计一条特异性的长滩军团菌荧光原位杂交探针,并验证其特异性与敏感度,初步建立长滩军团菌的荧光原位杂交检测法.方法 以长滩军团菌16S rRNA特异性位点设计杂交探针.在数据库中对探针序列进行特异性检验,优化反应条件,以军团菌标准菌株和环境分离菌株验证探针的特异性,并以模拟水样验证探针灵敏度.结果 生物信息学分析表明,设计的探针LEG long序列与长滩军团菌16S rRNA序列完全配对,与其他军团菌种均存在1个碱基以上的错配.菌株验证实验证明LEG long探针可与长滩军团菌的标准菌株和环境分离株特异性杂交,与其他军团菌种和非军团菌属菌株无杂交信号.探针检测灵敏度可达1.49×103CFU/ml.结论 本研究设计的探针LEG long可用于长滩军团菌的高特异性和高灵敏度检测.

作者:顾全;胡朝晖;赵利伟;范晓姗;严慧;朱庆义

来源:环境与健康杂志 2014 年 31卷 1期

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作者:
顾全;胡朝晖;赵利伟;范晓姗;严慧;朱庆义
来源:
环境与健康杂志 2014 年 31卷 1期
标签:
长滩军团菌 荧光原位杂交 探针 L.longbeachae Fluorescence in situ hybridization (FISH) Probe
目的 设计一条特异性的长滩军团菌荧光原位杂交探针,并验证其特异性与敏感度,初步建立长滩军团菌的荧光原位杂交检测法.方法 以长滩军团菌16S rRNA特异性位点设计杂交探针.在数据库中对探针序列进行特异性检验,优化反应条件,以军团菌标准菌株和环境分离菌株验证探针的特异性,并以模拟水样验证探针灵敏度.结果 生物信息学分析表明,设计的探针LEG long序列与长滩军团菌16S rRNA序列完全配对,与其他军团菌种均存在1个碱基以上的错配.菌株验证实验证明LEG long探针可与长滩军团菌的标准菌株和环境分离株特异性杂交,与其他军团菌种和非军团菌属菌株无杂交信号.探针检测灵敏度可达1.49×103CFU/ml.结论 本研究设计的探针LEG long可用于长滩军团菌的高特异性和高灵敏度检测.