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目的:筛选直肠癌组织异常表达的miRNAs.方法:采用miRCURY基因芯片(v.14.0)分析直肠癌组织和邻近非肿瘤组织之间差异表达的miRNA,设定平均上升或下降倍数大于2倍和P值小于0.05为差异标准.结果:88个miRNAs表达显著上调,其中46个基因已证实在结直肠癌组织中表达升高;40个miRNAs表达显著下调,其中15个已报道在结直肠癌组织中表达异常降低.实时定量PCR(RT-qPCR)结果显示:6个表达上调的miRNAs在直肠癌组织中也异常高表达,与基因芯片结果比较,表达水平相差从-11.88%至39.09%;同样6个表达下调的miRNAs在肿瘤组织中也呈低表达,与基因芯片结果比较,表达水平相差从1.35%至29.35%.基因芯片与RT-qPCR两方法分析的结果呈高度相关(r=0.96,P<0.01).结论:相对于混合样本(结直肠癌)miRNA表达谱,直肠癌miRNA表达谱呈现出明显的特异性;同时鉴定了一系列新的异常表达的miRNAs.

作者:李新华;张桂英;李乾;徐美华;冯德云;吴畏

来源:中南大学学报(医学版) 2012 年 37卷 7期

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作者:
李新华;张桂英;李乾;徐美华;冯德云;吴畏
来源:
中南大学学报(医学版) 2012 年 37卷 7期
标签:
微小RNAs 直肠癌 结肠癌 结直肠癌 基因表达谱
目的:筛选直肠癌组织异常表达的miRNAs.方法:采用miRCURY基因芯片(v.14.0)分析直肠癌组织和邻近非肿瘤组织之间差异表达的miRNA,设定平均上升或下降倍数大于2倍和P值小于0.05为差异标准.结果:88个miRNAs表达显著上调,其中46个基因已证实在结直肠癌组织中表达升高;40个miRNAs表达显著下调,其中15个已报道在结直肠癌组织中表达异常降低.实时定量PCR(RT-qPCR)结果显示:6个表达上调的miRNAs在直肠癌组织中也异常高表达,与基因芯片结果比较,表达水平相差从-11.88%至39.09%;同样6个表达下调的miRNAs在肿瘤组织中也呈低表达,与基因芯片结果比较,表达水平相差从1.35%至29.35%.基因芯片与RT-qPCR两方法分析的结果呈高度相关(r=0.96,P<0.01).结论:相对于混合样本(结直肠癌)miRNA表达谱,直肠癌miRNA表达谱呈现出明显的特异性;同时鉴定了一系列新的异常表达的miRNAs.