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目的:基于网络药理学及分子对接技术探讨红花治疗肺动脉高压(pulmonary hypertension,PH)的作用机制.方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台、本草组鉴数据库、中医综合数据库、中国知网检索红花的活性成分,并采用Swiss Target Prediction数据库预测相关靶标.在GeneCards数据库、DrugBank数据库、TTD数据库、在线人类孟德尔遗传数据库、DisGeNET数据库中检索PH疾病靶标.采用STRING数据库构建红花活性成分靶点及PH疾病靶标的蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并利用Cytoscape3.7.2软件获得红花治疗PH的潜在靶点的PPI网络,拓扑分析筛选红花治疗PH的潜在核心靶点.应用DAVID数据库及Metascape数据库对潜在核心靶点进行基因本体(gene on-tology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析,并构建"红花-活性成分-靶点-通路-PH"网络.采用AutoDock Vina 4.6.2软件对核心活性成分和靶点进行分子对接.结果:红花活性成分20种,相关靶点607个,PH相关靶点1 613个.潜在靶点PPI网络拓扑分析得到红花治疗PH的潜在核心靶点48个.GO功能富集分析共获得54个条目,包括生物过程20条、细胞组分14条及分子功能20条.KEGG信号通路富集分析共得

作者:张雯;唐雅伦;丛晓东;何沂;王冰;金沐阳;周瑞玲;张琼

来源:河南中医 2023 年 43卷 2期

知识库介绍

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作者:
张雯;唐雅伦;丛晓东;何沂;王冰;金沐阳;周瑞玲;张琼
来源:
河南中医 2023 年 43卷 2期
标签:
红花 肺动脉高压 分子对接 作用机制 网络药理学
目的:基于网络药理学及分子对接技术探讨红花治疗肺动脉高压(pulmonary hypertension,PH)的作用机制.方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台、本草组鉴数据库、中医综合数据库、中国知网检索红花的活性成分,并采用Swiss Target Prediction数据库预测相关靶标.在GeneCards数据库、DrugBank数据库、TTD数据库、在线人类孟德尔遗传数据库、DisGeNET数据库中检索PH疾病靶标.采用STRING数据库构建红花活性成分靶点及PH疾病靶标的蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并利用Cytoscape3.7.2软件获得红花治疗PH的潜在靶点的PPI网络,拓扑分析筛选红花治疗PH的潜在核心靶点.应用DAVID数据库及Metascape数据库对潜在核心靶点进行基因本体(gene on-tology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析,并构建"红花-活性成分-靶点-通路-PH"网络.采用AutoDock Vina 4.6.2软件对核心活性成分和靶点进行分子对接.结果:红花活性成分20种,相关靶点607个,PH相关靶点1 613个.潜在靶点PPI网络拓扑分析得到红花治疗PH的潜在核心靶点48个.GO功能富集分析共获得54个条目,包括生物过程20条、细胞组分14条及分子功能20条.KEGG信号通路富集分析共得