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目的 探讨虎杖药材治疗肺动脉高压(PAH)的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)和PubMed检索虎杖活性成分,构建活性成分库.通过TCMSP获取活性成分的潜在靶点,利用Uniprot数据库获取潜在靶基因.利用人类基因数据库(GeneCards)和人类孟德尔遗传数据库(OMIM)筛选PAH致病靶点与活性成分靶点基因,构建"药物-活性成分-疾病靶点"可视化网络.将潜在靶点导入String数据库,构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络;利用DAVID数据库将潜在靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.将节点度值排名前7的活性成分与排名前6的核心靶点利用AutoDock Tools和PyMOL软件进行分子对接和可视化分析.结果 筛选出活性成分39个,对应靶基因323个,与PAH共同靶点138个.经PPI网络分析,其中关键靶点涉及AKT1,VEGFA,TNF等;GO功能富集分析主要涉及低氧反应、炎性反应、血管再生等功能;KEGG通路富集分析主要涉及细胞增殖、细胞凋亡、炎性反应等信号通路;分子对接结果表明,虎杖药材活性成分白藜芦醇、木犀草素与AKT1,大黄素、芹黄素与TNF均有较好的亲和力.结论 虎杖药材可通过多种作用机制预防和治疗PAH.

作者:余志杰;陈兴;左建丽;何瑶;郑姣妮;郑晓媛

来源:中国药业 2022 年 31卷 12期

知识库介绍

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作者:
余志杰;陈兴;左建丽;何瑶;郑姣妮;郑晓媛
来源:
中国药业 2022 年 31卷 12期
标签:
网络药理学 虎杖 肺动脉高压 作用机制 分子对接
目的 探讨虎杖药材治疗肺动脉高压(PAH)的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)和PubMed检索虎杖活性成分,构建活性成分库.通过TCMSP获取活性成分的潜在靶点,利用Uniprot数据库获取潜在靶基因.利用人类基因数据库(GeneCards)和人类孟德尔遗传数据库(OMIM)筛选PAH致病靶点与活性成分靶点基因,构建"药物-活性成分-疾病靶点"可视化网络.将潜在靶点导入String数据库,构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络;利用DAVID数据库将潜在靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.将节点度值排名前7的活性成分与排名前6的核心靶点利用AutoDock Tools和PyMOL软件进行分子对接和可视化分析.结果 筛选出活性成分39个,对应靶基因323个,与PAH共同靶点138个.经PPI网络分析,其中关键靶点涉及AKT1,VEGFA,TNF等;GO功能富集分析主要涉及低氧反应、炎性反应、血管再生等功能;KEGG通路富集分析主要涉及细胞增殖、细胞凋亡、炎性反应等信号通路;分子对接结果表明,虎杖药材活性成分白藜芦醇、木犀草素与AKT1,大黄素、芹黄素与TNF均有较好的亲和力.结论 虎杖药材可通过多种作用机制预防和治疗PAH.