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目的:为探究"鱼腥草-靶点-角膜炎"的网络关系,应用网络药理学分析方法,分析探讨鱼腥草治疗角膜炎的潜在作用及分子机制.方法:以鱼腥草为研究对象,借助DisGeNET、STRING、中药系统药理学分析(TCMSP)平台、SwissADME、SwissTargetPridictiont等各在线数据库提供的数据信息,查询角膜炎相关蛋白及其互作网络、鱼腥草化学成分与活性成分、鱼腥草活性成分的预测靶点蛋白的相关数据,应用Cytoscape软件的可视化与网络合并功能,依次拟构角膜炎相关蛋白质互作网络、鱼腥草活性成分-预测靶点网络、鱼腥草活性成分-潜在靶点网络,整合分析上述拟构的网络,得到"鱼腥草活性成分-靶点-通路"网络,分析预测鱼腥草治疗角膜炎的潜在作用靶点及其在信号通路中的作用,探究鱼腥草治疗角膜炎的潜在作用机制.结果:共搜索到72个已分离鉴定的鱼腥草化学成分,角膜炎相关靶点65个,鱼腥草治疗角膜炎的潜在靶点50个,包含9个直接作用靶点.50个潜在靶点可被注释入303项GO术语中,由263项生物过程、18项细胞组分、22项分子功能所组成,显著富集于与炎症、感染(细菌、寄生虫)、免疫相关的通路上,具体为IL-17信号通路、Toll样受体信号通路、百日咳、美国锥虫病、炎症性肠病、类风湿性关节炎、肺结核、疟疾、NOD样受体信号通路、沙门氏菌感染等.

作者:李双;陈绍文;韩林涛;田代志;莫国艳;李杜军

来源:武汉大学学报(医学版) 2022 年 43卷 5期

知识库介绍

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作者:
李双;陈绍文;韩林涛;田代志;莫国艳;李杜军
来源:
武汉大学学报(医学版) 2022 年 43卷 5期
标签:
鱼腥草 角膜炎 网络药理学 蛋白互作网络 靶点 信号通路
目的:为探究"鱼腥草-靶点-角膜炎"的网络关系,应用网络药理学分析方法,分析探讨鱼腥草治疗角膜炎的潜在作用及分子机制.方法:以鱼腥草为研究对象,借助DisGeNET、STRING、中药系统药理学分析(TCMSP)平台、SwissADME、SwissTargetPridictiont等各在线数据库提供的数据信息,查询角膜炎相关蛋白及其互作网络、鱼腥草化学成分与活性成分、鱼腥草活性成分的预测靶点蛋白的相关数据,应用Cytoscape软件的可视化与网络合并功能,依次拟构角膜炎相关蛋白质互作网络、鱼腥草活性成分-预测靶点网络、鱼腥草活性成分-潜在靶点网络,整合分析上述拟构的网络,得到"鱼腥草活性成分-靶点-通路"网络,分析预测鱼腥草治疗角膜炎的潜在作用靶点及其在信号通路中的作用,探究鱼腥草治疗角膜炎的潜在作用机制.结果:共搜索到72个已分离鉴定的鱼腥草化学成分,角膜炎相关靶点65个,鱼腥草治疗角膜炎的潜在靶点50个,包含9个直接作用靶点.50个潜在靶点可被注释入303项GO术语中,由263项生物过程、18项细胞组分、22项分子功能所组成,显著富集于与炎症、感染(细菌、寄生虫)、免疫相关的通路上,具体为IL-17信号通路、Toll样受体信号通路、百日咳、美国锥虫病、炎症性肠病、类风湿性关节炎、肺结核、疟疾、NOD样受体信号通路、沙门氏菌感染等.