目的 建立生物信息学分析筛选肝癌基因芯片差异表达基因的方法,助力肝癌发病分子机制的研究.方法 通过R语言软件分析肝癌芯片数据GSE45436中肝癌组织和癌旁组织差异表达的基因,DAVID软件对差异表达基因进行GO功能富集及KEGG通路富集分析,String和Cytoscape软件分析关键基因和模块.结果 共筛选出375个差异表达明显的基因,其中表达上调和下调的分别有99个和296个.差异基因功能分析主要涉及细胞周期、p53信号通路、补体途径、细胞色素P450代谢通路等.蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络显示拓扑异构酶Ⅱα(TOP2A)可能与肝癌的发生发展最为相关.结论 本研究采用基因芯片结合生物信息学方法,构建了肝癌差异表达基因编码的蛋白互作网络.TOP2A可能是肝癌相关的核心基因.
作者：曹丹；余乐；王丽春
来源：四川大学学报（医学版） 2018 年 49卷 6期
