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目的 比较脉冲场凝胶电泳(PFGE)和两种国际多位点串联重复序列分析(MLVA)分型方法用于我国鼠伤寒沙门菌分子分型的能力,并初步确定适用于我国鼠伤寒沙门菌MLVA分型中的VNTR位点.方法 根据国际PulseNet公布的沙门菌PFGE分型方案、MLVA分型方案(包含7个VNTR位点,简称MLVA_PN)及欧洲食源性疾病监测网公布的鼠伤寒沙门菌MLVA分型方案(包含5个VNTR位点,简称MLVA-EU),对来自我国5个省(直辖市)的175株鼠伤寒沙门菌进行分子分型分析,并结合流行病学资料,评价这三种分型方法对我国分离的鼠伤寒沙门菌的分型能力.结果 175株鼠伤寒沙门菌经Xba Ⅰ酶切,PFGE后,获得56种带型,其分辨能力(D值)为0.8823.对其中的主优势带型JPXX01.CN0001菌株55株进一步用第二种内切酶BlnⅠ酶切后,获得6种带型.用MLVA_EU分型,获得96种型别,D值为0.9758.应用MLVA_PN分析,获得98种型别,D值为0.9763.两种MLVA分型方法对菌株的分辨能力几乎相同,且分型结果具有较高的一致性.对流行病学调查显示为鼠伤寒沙门菌暴发患者和食物来源的菌株进行PFGE双酶切及MLVA分型,三种分型方法获得一致性结果,均显示这些菌株具有明显的聚集性.结论 两种MLVA分型方法的分辨能力均高于PFGE,在确认鼠伤寒沙门菌引起的暴发事件时,采用需时较短,操作更方便的5个VNTR位

作者:张京云;聂艳妮;陈春霞;刁保卫;娄静;阚飙;闫梅英

来源:疾病监测 2011 年 26卷 4期

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作者:
张京云;聂艳妮;陈春霞;刁保卫;娄静;阚飙;闫梅英
来源:
疾病监测 2011 年 26卷 4期
标签:
鼠伤寒沙门菌 脉冲场凝胶电泳 多位点串联重复序列分析 分子分型
目的 比较脉冲场凝胶电泳(PFGE)和两种国际多位点串联重复序列分析(MLVA)分型方法用于我国鼠伤寒沙门菌分子分型的能力,并初步确定适用于我国鼠伤寒沙门菌MLVA分型中的VNTR位点.方法 根据国际PulseNet公布的沙门菌PFGE分型方案、MLVA分型方案(包含7个VNTR位点,简称MLVA_PN)及欧洲食源性疾病监测网公布的鼠伤寒沙门菌MLVA分型方案(包含5个VNTR位点,简称MLVA-EU),对来自我国5个省(直辖市)的175株鼠伤寒沙门菌进行分子分型分析,并结合流行病学资料,评价这三种分型方法对我国分离的鼠伤寒沙门菌的分型能力.结果 175株鼠伤寒沙门菌经Xba Ⅰ酶切,PFGE后,获得56种带型,其分辨能力(D值)为0.8823.对其中的主优势带型JPXX01.CN0001菌株55株进一步用第二种内切酶BlnⅠ酶切后,获得6种带型.用MLVA_EU分型,获得96种型别,D值为0.9758.应用MLVA_PN分析,获得98种型别,D值为0.9763.两种MLVA分型方法对菌株的分辨能力几乎相同,且分型结果具有较高的一致性.对流行病学调查显示为鼠伤寒沙门菌暴发患者和食物来源的菌株进行PFGE双酶切及MLVA分型,三种分型方法获得一致性结果,均显示这些菌株具有明显的聚集性.结论 两种MLVA分型方法的分辨能力均高于PFGE,在确认鼠伤寒沙门菌引起的暴发事件时,采用需时较短,操作更方便的5个VNTR位