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目的 了解不同血清群致病性钩体的脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)带型特征.方法 应用PFGE方法对65株不同血清群致病性钩体国际、国内参考菌株和疫苗株进行分型,并以此聚类分析,同时与菌株的多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、多位点串联重复序列数变化分析(multilocus VNTR analysis,MLVA)分型结果进行比较研究.结果 不同血清群致病性钩体基因组DNA经Not I酶切电泳后,获得了较高清晰度酶切图谱,各条带分离良好.65株钩体菌株分为61种PFGE型别.相同的血清群的钩体菌株的PFGE型别不尽相同.比较分析结果显示尽管PFGE、MLST和MLVA之间的分型结果不尽相同,但都具有较高的分辨率.聚类分析显示这些菌株可形成11个大小不一进化簇,呈现多点分散进化特征.结论 获得致病性钩体分子分型的第一手资料,为后续钩体分子溯源及流行病学研究提供科学指导.

作者:李喆;张影;杜宗利;叶强;徐颖华;辛晓芳

来源:中国人兽共患病学报 2022 年 38卷 6期

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作者:
李喆;张影;杜宗利;叶强;徐颖华;辛晓芳
来源:
中国人兽共患病学报 2022 年 38卷 6期
标签:
钩端螺旋体 脉冲场凝胶电泳 多位点序列分型 多位点串联重复序列数变化分析 聚类分析
目的 了解不同血清群致病性钩体的脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)带型特征.方法 应用PFGE方法对65株不同血清群致病性钩体国际、国内参考菌株和疫苗株进行分型,并以此聚类分析,同时与菌株的多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、多位点串联重复序列数变化分析(multilocus VNTR analysis,MLVA)分型结果进行比较研究.结果 不同血清群致病性钩体基因组DNA经Not I酶切电泳后,获得了较高清晰度酶切图谱,各条带分离良好.65株钩体菌株分为61种PFGE型别.相同的血清群的钩体菌株的PFGE型别不尽相同.比较分析结果显示尽管PFGE、MLST和MLVA之间的分型结果不尽相同,但都具有较高的分辨率.聚类分析显示这些菌株可形成11个大小不一进化簇,呈现多点分散进化特征.结论 获得致病性钩体分子分型的第一手资料,为后续钩体分子溯源及流行病学研究提供科学指导.