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目的 了解浙江省余姚市引起手足口病的病原构成,研究Cox A16基因特征及变异情况.方法 收集手足口病患者标本,用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time PCR)检测并分型,每年选择几个样品进行CoxA16 VP1基因的扩增和核苷酸序列测定,测序结果利用DNAstar和Blast软件进行比对分析.结果 2010-2012年从1651份标本检出柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)25.86%,肠道病毒71型(EV71) 39.85%,其他肠道病毒19.38%;Cox A16 VP1蛋白氨基酸序列相似性为99.3%~100%,7株Cox A16基因分型属于B1基因亚型.结论 2010-2012年余姚市手足口病流行的主要病原体为Cox A16和EV71,流行的Cox A16属于B1基因亚型,并具有高度相似性.

作者:张建群;李永东;罗学辉;袁士杰

来源:疾病监测 2014 年 29卷 11期

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作者:
张建群;李永东;罗学辉;袁士杰
来源:
疾病监测 2014 年 29卷 11期
标签:
手足口病 柯萨奇病毒A组16型 基因序列 Hand foot and mouth disease Coxsackie virus A16 Gene sequence
目的 了解浙江省余姚市引起手足口病的病原构成,研究Cox A16基因特征及变异情况.方法 收集手足口病患者标本,用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time PCR)检测并分型,每年选择几个样品进行CoxA16 VP1基因的扩增和核苷酸序列测定,测序结果利用DNAstar和Blast软件进行比对分析.结果 2010-2012年从1651份标本检出柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)25.86%,肠道病毒71型(EV71) 39.85%,其他肠道病毒19.38%;Cox A16 VP1蛋白氨基酸序列相似性为99.3%~100%,7株Cox A16基因分型属于B1基因亚型.结论 2010-2012年余姚市手足口病流行的主要病原体为Cox A16和EV71,流行的Cox A16属于B1基因亚型,并具有高度相似性.