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目的 了解2016年湖北省部分地区手足口病病原谱特征,对其中的柯萨奇病毒A组6型(Cox A6)和A组10型(Cox A10)基因特征进行分析.方法 采集2016年湖北省部分地区手足口病患者阳性标本,提取病毒核酸,通过一步法反转录-PCR扩增肠道病毒VP1序列并测序,经Blast比对确定病毒基因型.对其中Cox A6和Cox A10的VP1全长序列进行同源性和系统进化分析.结果 病原学监测结果显示,肠道病毒71型(EV71)阳性率为29.4% (599/2 035),柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)阳性率为25.7% (522/2 035),其他肠道病毒阳性率为44.9% (914/2 035).对该地区收集的83份肠道通用阳性的非EV71和非Cox A16进行病毒分型分析,Cox A6阳性检出率为56.6% (47/83),Cox A10阳性检出率为22.9% (19/83),还检测出其他肠道病毒如Cox A2(2株)、Cox A4(7株)、CB4(2株)、CB5(2株)、CB6(1株)、Echo5(1株)、Echo9(1株)和Echo25(1株).对Cox A6和Cox A10的VP1基因同源性比对及系统进化分析显示,2016年湖北省22株Cox A6的VP1基因核苷酸同源性为95.1% ~ 100.0%,11株Cox A10的VP1基因核苷酸同源性为95.2% ~ 100.0%.我国与其他国家Cox A6和Cox A10可分别划分为8个(A~H)和7个基因谱系(A ~G).湖北省Cox A6与我国其他Cox A6位于H基因谱系上;湖北省Cox A10与我国其

作者:李静;张婷;邹文菁;杨朝晖;占建波

来源:疾病监测 2017 年 32卷 6期

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作者:
李静;张婷;邹文菁;杨朝晖;占建波
来源:
疾病监测 2017 年 32卷 6期
标签:
手足口病 柯萨奇病毒A组6型 柯萨奇病毒A组10型 VP1基因 基因特征 Hand foot and mouth disease Coxsackievirus A6 Coxsackievirus A10 VP1 gene Genetic characteristic
目的 了解2016年湖北省部分地区手足口病病原谱特征,对其中的柯萨奇病毒A组6型(Cox A6)和A组10型(Cox A10)基因特征进行分析.方法 采集2016年湖北省部分地区手足口病患者阳性标本,提取病毒核酸,通过一步法反转录-PCR扩增肠道病毒VP1序列并测序,经Blast比对确定病毒基因型.对其中Cox A6和Cox A10的VP1全长序列进行同源性和系统进化分析.结果 病原学监测结果显示,肠道病毒71型(EV71)阳性率为29.4% (599/2 035),柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)阳性率为25.7% (522/2 035),其他肠道病毒阳性率为44.9% (914/2 035).对该地区收集的83份肠道通用阳性的非EV71和非Cox A16进行病毒分型分析,Cox A6阳性检出率为56.6% (47/83),Cox A10阳性检出率为22.9% (19/83),还检测出其他肠道病毒如Cox A2(2株)、Cox A4(7株)、CB4(2株)、CB5(2株)、CB6(1株)、Echo5(1株)、Echo9(1株)和Echo25(1株).对Cox A6和Cox A10的VP1基因同源性比对及系统进化分析显示,2016年湖北省22株Cox A6的VP1基因核苷酸同源性为95.1% ~ 100.0%,11株Cox A10的VP1基因核苷酸同源性为95.2% ~ 100.0%.我国与其他国家Cox A6和Cox A10可分别划分为8个(A~H)和7个基因谱系(A ~G).湖北省Cox A6与我国其他Cox A6位于H基因谱系上;湖北省Cox A10与我国其