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目的 分析2011-2012年阜阳市手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)患儿咽拭子标本分离的柯萨奇病毒A10型(coxsackievirus A10,CoxA 10) VP4区的基因特征,初步了解该病毒的变异情况.方法 对49份HFMD患儿的咽拭子标本进行病毒分离,出现人肠道病毒(human enterovirus,HEV)特征性病毒致细胞病变效应(cytopathic effect,CPE)后提取病毒RNA,用VP4区分型引物进行半巢式反转录-PCR,再通过测序和GenBank Blast比对确定病毒型别,并对其VP4区进行序列进化分析.结果 49份咽拭子标本有16份出现了特征性CPE,病毒分离阳性率32.7%.其中三株经鉴定为CoxA10,阳性率18.8%.它们的VP4区核苷酸序列同源性为95%~99%,与GenBank中参考毒株VP4区核苷酸序列同源性为77%~97%.其中与中国株HQO05431同源性为96%~97%,与中国株JN639887同源性为96% ~97%,与中国株FJ598089同源性为95% ~96%,与日本株AB282808同源性为85%~86%,与日本株AB162743同源性为87% ~ 89%,与CoxA10原型株Kow alik(AF081300)同源性为77% ~78%.进化分析表明这三株分离株与Kowalik株聚成一簇,均属于CoxA10,与日本各地分离的CoxA10的病毒核苷酸差异较大,但与我国本土分离株自成一簇.结论 2011-2012年阜阳地区手足口病病原体CoxA10 VP4与

作者:赵蕾;陈敬贤;王明丽

来源:中华疾病控制杂志 2013 年 17卷 6期

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作者:
赵蕾;陈敬贤;王明丽
来源:
中华疾病控制杂志 2013 年 17卷 6期
标签:
手足口病 柯萨奇病毒感染 序列同源性 Hand,foot and mouth disease Coxsackievirus infections Sequence homology
目的 分析2011-2012年阜阳市手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)患儿咽拭子标本分离的柯萨奇病毒A10型(coxsackievirus A10,CoxA 10) VP4区的基因特征,初步了解该病毒的变异情况.方法 对49份HFMD患儿的咽拭子标本进行病毒分离,出现人肠道病毒(human enterovirus,HEV)特征性病毒致细胞病变效应(cytopathic effect,CPE)后提取病毒RNA,用VP4区分型引物进行半巢式反转录-PCR,再通过测序和GenBank Blast比对确定病毒型别,并对其VP4区进行序列进化分析.结果 49份咽拭子标本有16份出现了特征性CPE,病毒分离阳性率32.7%.其中三株经鉴定为CoxA10,阳性率18.8%.它们的VP4区核苷酸序列同源性为95%~99%,与GenBank中参考毒株VP4区核苷酸序列同源性为77%~97%.其中与中国株HQO05431同源性为96%~97%,与中国株JN639887同源性为96% ~97%,与中国株FJ598089同源性为95% ~96%,与日本株AB282808同源性为85%~86%,与日本株AB162743同源性为87% ~ 89%,与CoxA10原型株Kow alik(AF081300)同源性为77% ~78%.进化分析表明这三株分离株与Kowalik株聚成一簇,均属于CoxA10,与日本各地分离的CoxA10的病毒核苷酸差异较大,但与我国本土分离株自成一簇.结论 2011-2012年阜阳地区手足口病病原体CoxA10 VP4与