目的 采用生物信息学研究方法分析大气污染物对成人和儿童外周血基因表达谱的影响,为后期开展有针对性的预防、诊断及治疗提供理论依据.方法 从基因芯片公共数据库(gene expression omnibus,GEO)中下载一组来自不同大气污染暴露下成人和儿童外周血基因芯片数据,将此数据导入分析软件QOE、GenClip、GATH-ER等,分析基因表达谱、蛋白-蛋白相互作用网络、分子生物学过程及基因功能,寻找大气污染对成人和儿童影响的关键节点基因.结果 在暴露源相同的情况下,儿童和成人差异基因不同,成人靶基因主要与细胞增殖、染色体修饰、DNA代谢和染色体组织有关,而儿童靶基因主要与血小板活化、细胞信号传导、有机生理过程等有关.进一步分析发现,FIGNL1、TUBB1、TPST1和SAMHD1基因为成人和儿童共同差异基因,这些基因主要与肿瘤的诱导及抑制有关.结论 不同程度污染对成人和儿童基因产生的影响不同,且在暴露源相同的情况下,儿童和成人差异基因亦不同,成人和儿童共同差异基因主要与肿瘤的诱导及抑制有关.
作者:孙娜;刘启玲;张荣强;张帆;李星慧;李向文
来源:中华疾病控制杂志 2018 年 22卷 7期