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目的 探讨河南省结核杆菌的遗传多样性.方法 使用26位点(经典24位点和其他2位点)的分支杆菌散在重复单元中数目可变串联重复序列(mycobacterium interspersed repetitive unit-variable number tandem repeat,MIRU-VNTR)和间隔区寡核苷酸分型(spoligotyping)对来自2015年期间河南省不同地区的668株结核杆菌分离株进行分型分析.对结核菌spoligotype类型和耐药表型的相关性进行分析.结果 Spoligotyping分析表明668株结核杆菌被分到10个不同的基因簇中.北京家族基因型是河南地区结核杆菌中的优势菌株.北京家族基因型菌株对四种一线药全耐药以及耐多药菌株比例明显高于非北京型菌株.668株结核杆菌通过26位点VNTR被分为567个不同的基因型.26个位点中15个位点具有高度或适中的分辨能力.10个分辨能力最强位点的组合分辨力能与26位点相当.结论 北京家族是河南省最流行的结核杆菌基因型.10位点VNTR和spoligotyping相结合可有效地用于河南省结核杆菌进化遗传学研究.

作者:石洁;郑丹薇;朱岩昆;马晓光;王少华;李辉;张国龙

来源:中华疾病控制杂志 2018 年 22卷 11期

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作者:
石洁;郑丹薇;朱岩昆;马晓光;王少华;李辉;张国龙
来源:
中华疾病控制杂志 2018 年 22卷 11期
标签:
结核分枝杆菌 26位点MIRU-VNTR 间隔区寡核苷酸分型
目的 探讨河南省结核杆菌的遗传多样性.方法 使用26位点(经典24位点和其他2位点)的分支杆菌散在重复单元中数目可变串联重复序列(mycobacterium interspersed repetitive unit-variable number tandem repeat,MIRU-VNTR)和间隔区寡核苷酸分型(spoligotyping)对来自2015年期间河南省不同地区的668株结核杆菌分离株进行分型分析.对结核菌spoligotype类型和耐药表型的相关性进行分析.结果 Spoligotyping分析表明668株结核杆菌被分到10个不同的基因簇中.北京家族基因型是河南地区结核杆菌中的优势菌株.北京家族基因型菌株对四种一线药全耐药以及耐多药菌株比例明显高于非北京型菌株.668株结核杆菌通过26位点VNTR被分为567个不同的基因型.26个位点中15个位点具有高度或适中的分辨能力.10个分辨能力最强位点的组合分辨力能与26位点相当.结论 北京家族是河南省最流行的结核杆菌基因型.10位点VNTR和spoligotyping相结合可有效地用于河南省结核杆菌进化遗传学研究.