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目的 了解深圳市2017年上半年流行的甲型H3N2亚型流感病毒HA和NA基因的分子进化特征,为预测流感病毒流行和变异提供科学依据.方法 利用DNAStar、MEGA 7.0等生物信息学软件对研究分离的40株H3N2流感病毒的HA和NA基因及其编码的氨基酸序列进行比对,构建分子进化树,分析基因特征和变异情况.结果 深圳分离株的同源性均达到97.8%~100.0%,位于亚洲北美人源分支.与世界卫生组织(World Health Organization,WHO)推荐的疫苗株A/Switzerland/9715293/2013(H3 N2)和A/Hong Kong/4801/2014(H3N2)相比,有较高的序列相似性;与当年疫苗株对比发现,HA发生6个抗原位点和2个受体结合位点的改变,NA出现第151位酶活性位点的改变;HA和NA的潜在N-糖基化位点在数量和位置上也发生变化.结论 深圳市2017年上半年甲型H3N2亚型流感病毒在流行过程中尚未发生明显变异,目前推荐的疫苗株仍对深圳地区人群有一定保护作用,HA和NA多个氨基酸位点的变异提示仍需加强H3N2亚型流感病毒分子水平的动态监测.

作者:范颖;李雪云;房师松;彭博

来源:中华疾病控制杂志 2019 年 23卷 9期

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作者:
范颖;李雪云;房师松;彭博
来源:
中华疾病控制杂志 2019 年 23卷 9期
标签:
H3N2亚型流感病毒 HA基因 NA基因 分子进化 序列分析
目的 了解深圳市2017年上半年流行的甲型H3N2亚型流感病毒HA和NA基因的分子进化特征,为预测流感病毒流行和变异提供科学依据.方法 利用DNAStar、MEGA 7.0等生物信息学软件对研究分离的40株H3N2流感病毒的HA和NA基因及其编码的氨基酸序列进行比对,构建分子进化树,分析基因特征和变异情况.结果 深圳分离株的同源性均达到97.8%~100.0%,位于亚洲北美人源分支.与世界卫生组织(World Health Organization,WHO)推荐的疫苗株A/Switzerland/9715293/2013(H3 N2)和A/Hong Kong/4801/2014(H3N2)相比,有较高的序列相似性;与当年疫苗株对比发现,HA发生6个抗原位点和2个受体结合位点的改变,NA出现第151位酶活性位点的改变;HA和NA的潜在N-糖基化位点在数量和位置上也发生变化.结论 深圳市2017年上半年甲型H3N2亚型流感病毒在流行过程中尚未发生明显变异,目前推荐的疫苗株仍对深圳地区人群有一定保护作用,HA和NA多个氨基酸位点的变异提示仍需加强H3N2亚型流感病毒分子水平的动态监测.