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目的:对贵州省3株甲3(H3N2)亚型流感病毒的血凝素基因HA1区序列进行分析.方法:提取核酸,PCR扩增,测序分析、比对.结果:同源性分析和系统发育树都说明了相同(或相近)年份的毒株核苷酸序列同源性较高.亲缘关系较近;不同年份的毒株核苷酸序列的同源性较低,素缘关系较远;3株H3N2毒株共有59各位点核苷酸替换.结论:通过序列测定分析,结果表明1995-2005年纵向比较,贵州省甲3(H3N2)亚型流感病毒的血凝素基因HA1区序列发生了变异;通过与Genbank上相应年份标准株横向比较,贵州省3株甲3(H3N2)亚型流感病毒的血凝素基因HA1区序列未发生大的变异,仅有少数核苷酸的替换.

作者:庄丽;庄妍;阎岩;胡静;付琳

来源:贵州医药 2011 年 35卷 3期

知识库介绍

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作者:
庄丽;庄妍;阎岩;胡静;付琳
来源:
贵州医药 2011 年 35卷 3期
标签:
贵州省 甲3(H3N2)亚型流感病毒 序列分析
目的:对贵州省3株甲3(H3N2)亚型流感病毒的血凝素基因HA1区序列进行分析.方法:提取核酸,PCR扩增,测序分析、比对.结果:同源性分析和系统发育树都说明了相同(或相近)年份的毒株核苷酸序列同源性较高.亲缘关系较近;不同年份的毒株核苷酸序列的同源性较低,素缘关系较远;3株H3N2毒株共有59各位点核苷酸替换.结论:通过序列测定分析,结果表明1995-2005年纵向比较,贵州省甲3(H3N2)亚型流感病毒的血凝素基因HA1区序列发生了变异;通过与Genbank上相应年份标准株横向比较,贵州省3株甲3(H3N2)亚型流感病毒的血凝素基因HA1区序列未发生大的变异,仅有少数核苷酸的替换.