目的 利用生物信息学方法对新克隆的GP1基因和蛋白序列进行分析,推测其在胃癌发生、发展过程中的作用.方法 以人类基因组数据库为基础,利用Megablast工具和SAGE数据库对GP1进行染色体定位和组织表达分布分析;应用BLAST进行GP1的基因结构分析和相似序列搜索;应用ORF finder对GP1编码的蛋白进行序列预测;应用ProParam、TMPRED等软件分析GP1编码蛋白质的理化性质、亚细胞定位及结构域等信息.结果 GP1基因全长1 362 bp,其最长开放读码框为801 bp,编码267个氨基酸,相似性搜索发现GP1基因片段与人AF083246基因片段具有很高的相似性(100
作者:郑洁;王丽娜;于恩燕;吕世军
来源:基础医学与临床 2010 年 30卷 12期