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目的设计能同时检测人SARS冠状病毒、尼巴病毒、亨德拉病毒、狂犬病毒、登革病毒、乙脑病毒和西尼罗病毒的基因芯片探针,制备芯片用于对广州野生动物携带这7种病毒的流行病学筛查.方法利用生物学软件DNAStar对7种病毒所有序列进行比对,获得每种病毒有意义的特异序列,以此作为设计oligo探针的备选序列,利用生物软件Array Designer 2.0设计特异性好、长度均一、Tm值相近的探针.结果每种病毒设计优化选择出10条oligo探针,用来制备基因检测芯片.结论利用GenBank数据库和生物学软件Array Designer 2.0设计病毒基因芯片检测探针,是一种简便、快速、有效的方法.

作者:李志峰;陈清;俞守义

来源:解放军预防医学杂志 2006 年 24卷 2期

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作者:
李志峰;陈清;俞守义
来源:
解放军预防医学杂志 2006 年 24卷 2期
标签:
基因芯片 oligo探针 Array Designer 2.0软件
目的设计能同时检测人SARS冠状病毒、尼巴病毒、亨德拉病毒、狂犬病毒、登革病毒、乙脑病毒和西尼罗病毒的基因芯片探针,制备芯片用于对广州野生动物携带这7种病毒的流行病学筛查.方法利用生物学软件DNAStar对7种病毒所有序列进行比对,获得每种病毒有意义的特异序列,以此作为设计oligo探针的备选序列,利用生物软件Array Designer 2.0设计特异性好、长度均一、Tm值相近的探针.结果每种病毒设计优化选择出10条oligo探针,用来制备基因检测芯片.结论利用GenBank数据库和生物学软件Array Designer 2.0设计病毒基因芯片检测探针,是一种简便、快速、有效的方法.