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目的利用冠状病毒全基因组芯片检测SARS患者血、便和痰标本中的冠状病毒核酸,为SARS病毒核酸的诊断提供线索.方法提取SARS患者血、便和痰样本中的冠状病毒RNA,经全基因组随机反转录和PCR扩增标记成荧光探针,与SARS病毒全基因组芯片进行杂交,同时用体外培养的病毒RNA和从健康人分离的白细胞的RNA分别做阳性和阴性对照,杂交后的芯片用Axon4100A扫描仪扫描和分析.结果 SARS患者的3种标本中都能检测到冠状病毒核酸的存在,与整个病毒基因组比较大都为一些不连续的片断.其中痰和便标本中的基因谱较为相似,并且发现编码S1蛋白的核酸在多数痰和便标本中是连续的.结论冠状病毒全基因组芯片能够检测出SARS患者血、便和痰标本中的冠状病毒核酸,同时能够监测不同样本中该病毒全基因组变化的特点,初步显示该芯片用于临床检测的可行性.

作者:范保星;刘又宁;孟凡义;任鲁风;吴小兵;张猛

来源:解放军医学杂志 2003 年 28卷 11期

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作者:
范保星;刘又宁;孟凡义;任鲁风;吴小兵;张猛
来源:
解放军医学杂志 2003 年 28卷 11期
标签:
冠状病毒 基因芯片 严重急性呼吸综合征(SARS)
目的利用冠状病毒全基因组芯片检测SARS患者血、便和痰标本中的冠状病毒核酸,为SARS病毒核酸的诊断提供线索.方法提取SARS患者血、便和痰样本中的冠状病毒RNA,经全基因组随机反转录和PCR扩增标记成荧光探针,与SARS病毒全基因组芯片进行杂交,同时用体外培养的病毒RNA和从健康人分离的白细胞的RNA分别做阳性和阴性对照,杂交后的芯片用Axon4100A扫描仪扫描和分析.结果 SARS患者的3种标本中都能检测到冠状病毒核酸的存在,与整个病毒基因组比较大都为一些不连续的片断.其中痰和便标本中的基因谱较为相似,并且发现编码S1蛋白的核酸在多数痰和便标本中是连续的.结论冠状病毒全基因组芯片能够检测出SARS患者血、便和痰标本中的冠状病毒核酸,同时能够监测不同样本中该病毒全基因组变化的特点,初步显示该芯片用于临床检测的可行性.