目的 通过对2型、5型人腺病毒DNA(Adv2、5 DNA)与Adv12 DNA及大肠杆菌DNA(EC DNA)序列进行对比研究,确定Adv2、5 DNA中能够拮抗细菌DNA的可能的活性片段--抑制性CpG寡核苷酸(CpG-N ODN).方法 从NCBI核酸数据库中获取Adv2、5、12 DNA和EC DNA序列,采用DNATools、BioEdit等软件对Adv2、5、12 DNA和EC DNA进行序列分析和比较,确定Adv2、5 DNA特征性的CpG基序,查找出Adv2、5DNA中以上述CpG基序为核心的12碱基寡核苷酸(12-ODN).结果 确定了19种Adv2、5 DNA特征性的CpG基序,Adv2、5 DNA中以这19种CpG基序为核心的12-ODN共504条.结论 504条12-ODN可能是Adv2、5 DNA的CpG-N ODN.
作者:王良喜;丁国富;鲁永玲;罗平;周红
来源:解放军医学杂志 2006 年 31卷 11期