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目的 应用网络药理学分析方法及分子对接技术研究半夏-黄连药对治疗胃食管反流病(GERD)的作用机制.方法 应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和Genecard数据库分别筛选出半夏、黄连的有效成分和GERD的相关靶点;采用Cytoscape软件绘制药物-疾病靶点的调控网络图;采用STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络;采用AutoDock软件进行分子对接预测药物与疾病靶点的结合性,通过Pymol软件实现对接结果可视化,构建相互对接模式图;运用R软件对有效靶点进行GO基因功能分析及KEGG通路分析.结果 半夏-黄连有效成分共27个,GERD相关靶点2960个,半夏黄连-GERD取交集后得到106个靶点.分子对接结果显示,苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、半胱天冬酶3(GASP3)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、人原癌基因(JUN)、白细胞介素-6(IL-6)与槲皮素、黄芩苷、β-谷甾醇具有较好结合活性,基因功能分析共969条,信号通路121条.结论 半夏-黄连具有多成分、多靶点及多通路的特性,主要通过抑制炎症反应、降低氧化作用、促进肿瘤细胞凋亡等过程发挥治疗GERD的作用.

作者:甘丽华;李志敏;何泉;杨坤;郭超峰

来源:实用临床医药杂志 2021 年 25卷 21期

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作者:
甘丽华;李志敏;何泉;杨坤;郭超峰
来源:
实用临床医药杂志 2021 年 25卷 21期
标签:
半夏;黄连;药对;胃食管反流病;分子对接;网络药理学
目的 应用网络药理学分析方法及分子对接技术研究半夏-黄连药对治疗胃食管反流病(GERD)的作用机制.方法 应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和Genecard数据库分别筛选出半夏、黄连的有效成分和GERD的相关靶点;采用Cytoscape软件绘制药物-疾病靶点的调控网络图;采用STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络;采用AutoDock软件进行分子对接预测药物与疾病靶点的结合性,通过Pymol软件实现对接结果可视化,构建相互对接模式图;运用R软件对有效靶点进行GO基因功能分析及KEGG通路分析.结果 半夏-黄连有效成分共27个,GERD相关靶点2960个,半夏黄连-GERD取交集后得到106个靶点.分子对接结果显示,苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、半胱天冬酶3(GASP3)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、人原癌基因(JUN)、白细胞介素-6(IL-6)与槲皮素、黄芩苷、β-谷甾醇具有较好结合活性,基因功能分析共969条,信号通路121条.结论 半夏-黄连具有多成分、多靶点及多通路的特性,主要通过抑制炎症反应、降低氧化作用、促进肿瘤细胞凋亡等过程发挥治疗GERD的作用.