目的 分析2011年景德镇地区重症手足口病患儿标本肠道病毒71型(EV71)分离株2011JDZ35全基因组序列特征.方法 采集重症手足口病患儿咽拭子标本,进行病毒分离和逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增分离病毒的全基因组序列,并进行全基因组核苷酸序列测定,参考EV71 A、B、C各基因型的参考毒株和国内外分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 2011JDZ35株的基因组长度为7406 bp,其中包括5′端非编码区(5′UTR)长742 bp,病毒基因组编码区(ORF)全长6582 bp及3′端非编码区(3′UTR)长82 bp.ORF编码含2193个氨基酸残基的多聚蛋白.2011JDZ35株基因组的结构与FY08-C30-P14、EV71/Ningbo.CHN/065/2010、HZ08/Hangzhou/2008十分接近,整个基因组的核苷酸同源性分别为97.3
作者:涂智杰;胡芹;曹金萍;蔡年娥;吴建英;宋建新;余慧宏
来源:军事医学 2013 年 37卷 1期