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目的 了解2010年长沙市手足口病(hand-foot-mouth disease,HFMD)重症和普通病例肠道病毒71型(hu-man Enterovirus 71,EV71)VP1区基因特征.方法 收集12例HFMD重症和普通病例的咽拭子或肛拭子标本进行VP1区基因RT-PCR扩增和核苷酸序列测定,测序结果利用sequin软件提交至GenBank,Lasergene和Mega5软件对测序结果进行氨基酸比对分析和构建进化树.结果 12株EV71 VP1区基因序列在进化树上与C基因型中的C4<'a>亚型代表株属同一分支,在核苷酸同源性分析中,12株EV71与C4<'a>亚型代表株(3254-TAI-98)的同源性达到92.6

作者:欧新华;张如胜;叶文;宋克云;孙边成;陈法明

来源:实用预防医学 2011 年 18卷 3期

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作者:
欧新华;张如胜;叶文;宋克云;孙边成;陈法明
来源:
实用预防医学 2011 年 18卷 3期
标签:
手足口病 肠道病毒71型 VP1 序列分析
目的 了解2010年长沙市手足口病(hand-foot-mouth disease,HFMD)重症和普通病例肠道病毒71型(hu-man Enterovirus 71,EV71)VP1区基因特征.方法 收集12例HFMD重症和普通病例的咽拭子或肛拭子标本进行VP1区基因RT-PCR扩增和核苷酸序列测定,测序结果利用sequin软件提交至GenBank,Lasergene和Mega5软件对测序结果进行氨基酸比对分析和构建进化树.结果 12株EV71 VP1区基因序列在进化树上与C基因型中的C4<'a>亚型代表株属同一分支,在核苷酸同源性分析中,12株EV71与C4<'a>亚型代表株(3254-TAI-98)的同源性达到92.6