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由立枯丝核菌Rhizoctonia solani引起的水稻纹枯病(rice sheath blight)是水稻三大病害之一.G蛋白β亚基(G-protein beta-subunit)编码的蛋白作为重要的信号传导蛋白,在其致病分子机制中起着重要作用.为了解G蛋白β亚基基因的作用方式,本文根据同源物种G蛋白β亚基相关序列设计引物,通过PCR(polymerase chain reaction)和RT-PCR(reverse transcriptase PCR)技术,获得了以水稻为寄主的立枯丝核菌G蛋白β亚基(G-protein beta-subunit of rice Rhizoctonia solani,简写gbrrs1)的基因序列和开放阅读框ORF(open reading frame)(GenBank登录号EU267677).该基因全长1867bp,含有4个内含子和5个外显子,各内含子长度在54bp-65bp,且序列均符合5'-gt……ag-3,模式.开放阅读框1047bp,编码348aa,推测的蛋白质分子量为38.23kDa,等电点为6.54.该蛋白质具有2个alpha-helix和7个beta sheet的二级结构,每个beta sheet又包含4个beta-strand.gbrrs1在N端有2个alpha-helix,紧接着是由7个beta sheet由无规则卷曲连接形成的桶形结构.GenBank Blast结果表明,gbrrsl与四种真菌生物G蛋白β亚基的氨基酸序列同源性较高,与Lentinula edodes(AAT74567.1)、Coprinopsis cinema(EAU92269)、Ustilago maydis(AAN33051)和Filobasidiella neo

作者:曲广林;李仕贵;徐正君;王玉平;黄文娟;林瑜凡;万佳;马炳田

来源:菌物学报 2008 年 27卷 5期

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曲广林;李仕贵;徐正君;王玉平;黄文娟;林瑜凡;万佳;马炳田
来源:
菌物学报 2008 年 27卷 5期
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信号传导 开放阅读框 原核表达
由立枯丝核菌Rhizoctonia solani引起的水稻纹枯病(rice sheath blight)是水稻三大病害之一.G蛋白β亚基(G-protein beta-subunit)编码的蛋白作为重要的信号传导蛋白,在其致病分子机制中起着重要作用.为了解G蛋白β亚基基因的作用方式,本文根据同源物种G蛋白β亚基相关序列设计引物,通过PCR(polymerase chain reaction)和RT-PCR(reverse transcriptase PCR)技术,获得了以水稻为寄主的立枯丝核菌G蛋白β亚基(G-protein beta-subunit of rice Rhizoctonia solani,简写gbrrs1)的基因序列和开放阅读框ORF(open reading frame)(GenBank登录号EU267677).该基因全长1867bp,含有4个内含子和5个外显子,各内含子长度在54bp-65bp,且序列均符合5'-gt……ag-3,模式.开放阅读框1047bp,编码348aa,推测的蛋白质分子量为38.23kDa,等电点为6.54.该蛋白质具有2个alpha-helix和7个beta sheet的二级结构,每个beta sheet又包含4个beta-strand.gbrrs1在N端有2个alpha-helix,紧接着是由7个beta sheet由无规则卷曲连接形成的桶形结构.GenBank Blast结果表明,gbrrsl与四种真菌生物G蛋白β亚基的氨基酸序列同源性较高,与Lentinula edodes(AAT74567.1)、Coprinopsis cinema(EAU92269)、Ustilago maydis(AAN33051)和Filobasidiella neo