目的 研究重庆市南川地区人乳头瘤病毒(H PV)31 E6基因多态性,为H PV疫苗设计和H PV防治提供依据.方法 采用PCR扩增和导流杂交技术检测HPV31阳性患者宫颈脱落细胞HPV31 E6基因,通过测序并与参考序列对比寻找变异位点.使用ProPred-Ⅰserver和ABC pred server分析HPV31 E6蛋白的二级结构并寻找理想的B细胞免疫表位.结果 与参考序列HPV31 REF对比,40株HPV31病毒株中,与参考序列E6基因完全一致的病毒株为10株,占25.0%;HPV31 E6基因突变株14株,占35.0%,其中非同义突变6个,同义突变8个,主要的非同义突变为C520T(A138V)和C285T(H60Y),主要的同义突变为A321T、G404A、A428G和C176T.寻找到理想的B细胞免疫表位10个,最理想的HPV31 E6蛋白B细胞预测免疫表位为441PEEKQRHLDKKKRF455和285HGVCTKCLRFYSKVSE301.结论 该地区HPV31 E6基因分布呈多态性,该研究数据对H PV的防治和疫苗设计有指导价值.
作者:汪文明;陈林;李跃梅;周靖;丁正林
来源:检验医学与临床 2019 年 16卷 16期