目的:观察大鼠心力衰竭细胞中microRNA ( miRNA)表达变化,利用生物信息学分析技术探索差异miRNA靶基因的功能。方法18只成年雄性SD大鼠,体质量200~220g,随机数字表法随机分为两组:正常对照组( CON组)和心力衰竭组( HF组)。 HF组制备阿霉素致心力衰竭模型, CON组注射等量生理盐水。提取大鼠心脏, Largendorff逆行灌注法分离心室肌细胞,提取总RNA行miRNA表达谱检测,筛选两组差异表达的miRNA,荧光定量RT-PCR 技术验证结果, Targetscan、 miRanda软件预测差异表达miRNA的靶基因,并对靶基因行生物信息学分析。结果芯片检测结果显示,与CON组相比, HF组共有37个miRNA表达发生显著改变,其中22个miRNA上调,15个miRNA下调(均P<0.01, FDR<0.05)。荧光定量RT-PCR检测miR-133b-5p (t =14.56, P<0.1)、 miR-6216(t=9.32, P<0.1)、 let-7e-5p ( t=13.92, P<0.1)表达水平,变化趋势与芯片结果一致。生物信息学分析显示,差异表达miRNA调控的靶基因显著富集于31个基因组(均P<0.01, FDR<0.05)和12条信号通路(均P<0.05, FDR<0.05),其中泛素蛋白酶体系统、 MAPK信号通路、 Toll样受体信号通路富集程度较高。结论阿霉素诱导的心力衰竭模型大鼠心肌细胞中miRNA表达谱发
作者:朱海娟;何淑芳;金世云;胡军;张野
来源:中华急诊医学杂志 2016 年 25卷 4期