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目的:探讨口腔鳞状细胞癌(OSCC)细胞异质性及三级淋巴结构(TLS)对患者免疫细胞数量及功能的影响,以建立OSCC的免疫图谱,解析TLS在OSCC发病机制中的作用.方法:利用生物信息学方法对初诊OSCC患者肿瘤组织的单细胞转录组测序数据进行数据降维、细胞分群,并对细胞群体进行注释;比较分析TLS-/+患者免疫细胞群体的差异及内在分子特征差异;利用R编程语言及多种R包对数据分析结果进行可视化展示.结果:OSCC患者中存在异质性细胞群体,其中含典型的免疫细胞群体;TLS+患者的免疫细胞比例显著增加;TLS+患者的T细胞群体显著富集与T细胞分化、活化及信号转导相关等信号通路相关;单核巨噬细胞群体的差异分析结果显示,TLS+患者在干扰素信号应答、细胞因子产生等通路显著富集.结论:OSCC患者中存在明显的异质性免疫细胞群体,并且这些免疫细胞群体在TLS+/-患者中存在显著的分子差异,这对研究OSCC发病机制、预后及未来潜在的靶向治疗具有重要的提示意义.

作者:苏怡文;邱晓慧;刘俊

来源:口腔生物医学 2021 年 12卷 4期

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作者:
苏怡文;邱晓慧;刘俊
来源:
口腔生物医学 2021 年 12卷 4期
标签:
口腔鳞状细胞癌;单细胞转录组测序;三级淋巴结构;免疫细胞;生物信息学分析
目的:探讨口腔鳞状细胞癌(OSCC)细胞异质性及三级淋巴结构(TLS)对患者免疫细胞数量及功能的影响,以建立OSCC的免疫图谱,解析TLS在OSCC发病机制中的作用.方法:利用生物信息学方法对初诊OSCC患者肿瘤组织的单细胞转录组测序数据进行数据降维、细胞分群,并对细胞群体进行注释;比较分析TLS-/+患者免疫细胞群体的差异及内在分子特征差异;利用R编程语言及多种R包对数据分析结果进行可视化展示.结果:OSCC患者中存在异质性细胞群体,其中含典型的免疫细胞群体;TLS+患者的免疫细胞比例显著增加;TLS+患者的T细胞群体显著富集与T细胞分化、活化及信号转导相关等信号通路相关;单核巨噬细胞群体的差异分析结果显示,TLS+患者在干扰素信号应答、细胞因子产生等通路显著富集.结论:OSCC患者中存在明显的异质性免疫细胞群体,并且这些免疫细胞群体在TLS+/-患者中存在显著的分子差异,这对研究OSCC发病机制、预后及未来潜在的靶向治疗具有重要的提示意义.