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目的:探讨AKR1C3在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)中的表达水平及其功能.方法:从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中筛选OSCC相关芯片数据集,利用R语言筛选出芯片中的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),对DEGs进行功能富集分析,构建蛋白质相互作用网络图(pro-tein-protein interaction network,PPI)及DEGs相关性图,分析DEGs AKR1C3的表达水平与预后的关系,并通过免疫组织化学法验证AKR1C3蛋白在OSCC中的表达.结果:共筛选出411个DEGs,其中显著上、下调的DEGs分别有20个;DEGs主要参与T细胞活化、淋巴细胞活化等过程,并富集于细胞因子间的相互作用、流体剪切应力与动脉粥样硬化等通路;PPI显示:AKR1C3与AKR1C1、AKR1B10、AKR1B1等关系最为密切,DEGs相关性分析显示:AKR1C3与ALDH3A1、UGT1Ab等关系最为密切;AKR1C3高表达的患者生存期更短(P<0.05);免疫组织化学法结果提示:AKR1C3蛋白在OSCC组织中表达上调(P<0.05).结论:AKR1C3可作为潜在分子标志物用于OSCC的早期诊断、治疗靶点的选择和预后评估.

作者:李磊;陈彦平;杨凯成;李悠;王欣晨;罗风玉

来源:口腔医学研究 2021 年 37卷 6期

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作者:
李磊;陈彦平;杨凯成;李悠;王欣晨;罗风玉
来源:
口腔医学研究 2021 年 37卷 6期
标签:
口腔鳞状细胞癌 基因表达数据库 分子标志物 差异表达基因
目的:探讨AKR1C3在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)中的表达水平及其功能.方法:从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中筛选OSCC相关芯片数据集,利用R语言筛选出芯片中的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),对DEGs进行功能富集分析,构建蛋白质相互作用网络图(pro-tein-protein interaction network,PPI)及DEGs相关性图,分析DEGs AKR1C3的表达水平与预后的关系,并通过免疫组织化学法验证AKR1C3蛋白在OSCC中的表达.结果:共筛选出411个DEGs,其中显著上、下调的DEGs分别有20个;DEGs主要参与T细胞活化、淋巴细胞活化等过程,并富集于细胞因子间的相互作用、流体剪切应力与动脉粥样硬化等通路;PPI显示:AKR1C3与AKR1C1、AKR1B10、AKR1B1等关系最为密切,DEGs相关性分析显示:AKR1C3与ALDH3A1、UGT1Ab等关系最为密切;AKR1C3高表达的患者生存期更短(P<0.05);免疫组织化学法结果提示:AKR1C3蛋白在OSCC组织中表达上调(P<0.05).结论:AKR1C3可作为潜在分子标志物用于OSCC的早期诊断、治疗靶点的选择和预后评估.