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目的 通过对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中胃腺癌转录组数据进行分析,找出预后相关的差异表达基因.方法 从TCGA数据库中下载胃腺癌的转录组数据,利用R语言edgeR包筛选出差异基因后,对差异基因进行生存分析.结果 共得到175个差异表达miRNA及201个差异表达mRNA/lncRNA,进一部进行生存分析,以P<0.05作为统计筛选标准,得到15个miRNA和9个mRNA、8个lncRNA与胃癌的生存时间相关.结论 通过对TCGA数据库中胃腺癌的表达数据进行分析研究,选出与该病预后密切相关的基因,为该病的早期诊断和靶向治疗提供分子层面的参考信息.

作者:田如月;郭水龙;曹邦伟

来源:临床和实验医学杂志 2020 年 19卷 5期

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作者:
田如月;郭水龙;曹邦伟
来源:
临床和实验医学杂志 2020 年 19卷 5期
标签:
胃癌 预后 生物标志物
目的 通过对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中胃腺癌转录组数据进行分析,找出预后相关的差异表达基因.方法 从TCGA数据库中下载胃腺癌的转录组数据,利用R语言edgeR包筛选出差异基因后,对差异基因进行生存分析.结果 共得到175个差异表达miRNA及201个差异表达mRNA/lncRNA,进一部进行生存分析,以P<0.05作为统计筛选标准,得到15个miRNA和9个mRNA、8个lncRNA与胃癌的生存时间相关.结论 通过对TCGA数据库中胃腺癌的表达数据进行分析研究,选出与该病预后密切相关的基因,为该病的早期诊断和靶向治疗提供分子层面的参考信息.