您的账号已在其他设备登录,您当前账号已强迫下线,
如非您本人操作,建议您在会员中心进行密码修改

确定
收藏 | 浏览48 | 下载32

目的 乳腺癌患者术后血液里的肿瘤细胞数是复发率升高和生存率降低的独立影响因素.丙泊酚虽然已经被证实能减少乳腺癌患者术后血液循环里的肿瘤数,但是丙泊酚是否能直接与乳腺癌细胞相互作用、通过什么受体与乳腺癌细胞相互作用仍然处于未知状态,因此本研究通过网络药理学技术、癌症基因组图谱(TCGA)数据挖掘、分子对接技术试图探索出丙泊酚与乳腺癌细胞直接作用的靶点及相关的通路.方法 在PubChem数据库中检索出丙泊酚的3D结构和Canonical smiles序列并在Swiss Target prediction、Chembl、Drugbank三个数据库中整合出丙泊酚的作用位点,在Uniprot数据库中转换成基因名称.在DisGeNet、Gene cards数据库中检索出与乳腺癌相关的基因.将上述两组基因数据集取交集得到19个共有基因.将得到的基因进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)、基因本体论(GO)富集分析.筛选出与乳腺癌相关的KEGG通路和基因,并在TCGA乳腺癌的基因表达数据集中对筛选出的基因进行验证.最后使用分子对接技术将丙泊酚分子和雌激素受体α(ESRα)进行对接验证.结果 丙泊酚作用靶点数据集与乳腺癌相关基因数据集有19个共有基因,KEGG分析中雌激素信号通路是与乳腺癌最相关的通路,富集在这条通路上的基因有γ氨基丁酸B型受体基因(GABBR1,GABBR2)

作者:焦梓茵;杨峰;林成新

来源:临床麻醉学杂志 2023 年 39卷 1期

知识库介绍

临床诊疗知识库该平台旨在解决临床医护人员在学习、工作中对医学信息的需求,方便快速、便捷的获取实用的医学信息,辅助临床决策参考。该库包含疾病、药品、检查、指南规范、病例文献及循证文献等多种丰富权威的临床资源。

详细介绍
热门关注
免责声明:本知识库提供的有关内容等信息仅供学习参考,不代替医生的诊断和医嘱。

收藏
| 浏览:48 | 下载:32
作者:
焦梓茵;杨峰;林成新
来源:
临床麻醉学杂志 2023 年 39卷 1期
标签:
丙泊酚 乳腺癌 网络药理学 雌激素受体α
目的 乳腺癌患者术后血液里的肿瘤细胞数是复发率升高和生存率降低的独立影响因素.丙泊酚虽然已经被证实能减少乳腺癌患者术后血液循环里的肿瘤数,但是丙泊酚是否能直接与乳腺癌细胞相互作用、通过什么受体与乳腺癌细胞相互作用仍然处于未知状态,因此本研究通过网络药理学技术、癌症基因组图谱(TCGA)数据挖掘、分子对接技术试图探索出丙泊酚与乳腺癌细胞直接作用的靶点及相关的通路.方法 在PubChem数据库中检索出丙泊酚的3D结构和Canonical smiles序列并在Swiss Target prediction、Chembl、Drugbank三个数据库中整合出丙泊酚的作用位点,在Uniprot数据库中转换成基因名称.在DisGeNet、Gene cards数据库中检索出与乳腺癌相关的基因.将上述两组基因数据集取交集得到19个共有基因.将得到的基因进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)、基因本体论(GO)富集分析.筛选出与乳腺癌相关的KEGG通路和基因,并在TCGA乳腺癌的基因表达数据集中对筛选出的基因进行验证.最后使用分子对接技术将丙泊酚分子和雌激素受体α(ESRα)进行对接验证.结果 丙泊酚作用靶点数据集与乳腺癌相关基因数据集有19个共有基因,KEGG分析中雌激素信号通路是与乳腺癌最相关的通路,富集在这条通路上的基因有γ氨基丁酸B型受体基因(GABBR1,GABBR2)