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目的 利用网络药理学和分子对接技术预测熟地平颤方治疗帕金森病(PD)的主要活性成分、潜在靶点及其分子作用机制.方法 借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和TCM@TAIWAN台湾中医药资料库、PubChem、Swiss Target Prediction平台筛选熟地平颤方中药的主要化学成分及其作用靶点,利用GeneCards和DisGeNET数据库筛选PD的相关靶点,STRING和Cytoscape软件构建共同靶点蛋白相互作用网络(PPI)及中药-活性成分-靶点网络图.通过Metascape对关键靶点进行基因本体论(GO)、DisGeNET功能富集和京都基因与基因组百科全书数据库(KEGG)通路富集分析.运用iGEMDOCK软件进行批量分子对接实验.结果 筛选出熟地平颤方29个主要活性成分,178个与PD共有的作用靶点,主要核心靶点包括AKT1、ALB、MAPK3、CASP3和APP等.GO功能和KEGG通路富集显示该方调控蛋白丝氨酸/苏氨酸及酪氨酸蛋白激酶、神经递质受体、肽链内切酶等多种分子功能,通过神经活动配体-受体相互作用、cAMP、雌激素、磷脂酶D等多种信号通路发挥治疗PD的作用.DisGeNET功能富集结果表明熟地平颤方广泛参与了认知障碍、淀粉样变性、记忆缺陷、神经痛和成瘾行为等方面的改善.分子对接结果显示羊毛甾醇、胆固醇与前列腺素G/H合酶2(PTGS2),α1-谷甾醇与白蛋白(ALB)均有

作者:邱添;李泰平;肖红;刘卫国;康冰;杨宁

来源:临床神经病学杂志 2022 年 35卷 4期

知识库介绍

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作者:
邱添;李泰平;肖红;刘卫国;康冰;杨宁
来源:
临床神经病学杂志 2022 年 35卷 4期
标签:
熟地平颤方 网络药理学 分子对接 帕金森病 分子机制
目的 利用网络药理学和分子对接技术预测熟地平颤方治疗帕金森病(PD)的主要活性成分、潜在靶点及其分子作用机制.方法 借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和TCM@TAIWAN台湾中医药资料库、PubChem、Swiss Target Prediction平台筛选熟地平颤方中药的主要化学成分及其作用靶点,利用GeneCards和DisGeNET数据库筛选PD的相关靶点,STRING和Cytoscape软件构建共同靶点蛋白相互作用网络(PPI)及中药-活性成分-靶点网络图.通过Metascape对关键靶点进行基因本体论(GO)、DisGeNET功能富集和京都基因与基因组百科全书数据库(KEGG)通路富集分析.运用iGEMDOCK软件进行批量分子对接实验.结果 筛选出熟地平颤方29个主要活性成分,178个与PD共有的作用靶点,主要核心靶点包括AKT1、ALB、MAPK3、CASP3和APP等.GO功能和KEGG通路富集显示该方调控蛋白丝氨酸/苏氨酸及酪氨酸蛋白激酶、神经递质受体、肽链内切酶等多种分子功能,通过神经活动配体-受体相互作用、cAMP、雌激素、磷脂酶D等多种信号通路发挥治疗PD的作用.DisGeNET功能富集结果表明熟地平颤方广泛参与了认知障碍、淀粉样变性、记忆缺陷、神经痛和成瘾行为等方面的改善.分子对接结果显示羊毛甾醇、胆固醇与前列腺素G/H合酶2(PTGS2),α1-谷甾醇与白蛋白(ALB)均有