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目的:利用网络药理学和分子对接技术对葛花枳椇子治疗酒精性肝损伤(ALI)的潜在作用机制进行研究.方法:先利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和Swiss数据库搜集与葛花、枳椇子药材相关的化学成分及作用靶点,并以口服利用度(OB)≥30%和类药性(DL)≥0.18对化合物进行筛选;同时,使用GeneCard、DrugBank数据库获取与ALI相关的靶点,借助韦恩图映射葛花枳椇子治疗ALI的潜在作用靶点,再采用String数据库和Cytoscape软件构建蛋白蛋白相互作用网络及"药材潜在活性成分作用靶点"相互作用网络;接着在DAVID和Reactome数据库中对潜在作用靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;最后,使用AutoDock Vina软件将潜在活性成分与核心靶点进行分子对接验证.结果:在葛花枳椇子中,共筛选出21个与疾病相关的潜在活性成分和431个潜在作用靶点,涉及蛋白结合、ATP结合等273种生物功能及磷脂酰肌醇3-激酶蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、TNF信号通路等90条KEGG代谢通路和信号转导、免疫系统等362条Reactome通路.分子对接结果显示,21个潜在活性成分与核心靶点蛋白激酶B(Akt)1、肿瘤蛋白p53(TP53)、IL-6均有较好的亲和力.结论:本研究结果揭示了葛花枳椇子治疗ALI的多成分、多靶点、多途径的作用特点

作者:汪亚楠;闫孝明;张晴宇;宋爱华;韩飞

来源:浙江大学学报(医学版) 2020 年 49卷 6期

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作者:
汪亚楠;闫孝明;张晴宇;宋爱华;韩飞
来源:
浙江大学学报(医学版) 2020 年 49卷 6期
标签:
酒精性肝损伤 葛花枳椇子 网络药理学 分子对接 作用机制
目的:利用网络药理学和分子对接技术对葛花枳椇子治疗酒精性肝损伤(ALI)的潜在作用机制进行研究.方法:先利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和Swiss数据库搜集与葛花、枳椇子药材相关的化学成分及作用靶点,并以口服利用度(OB)≥30%和类药性(DL)≥0.18对化合物进行筛选;同时,使用GeneCard、DrugBank数据库获取与ALI相关的靶点,借助韦恩图映射葛花枳椇子治疗ALI的潜在作用靶点,再采用String数据库和Cytoscape软件构建蛋白蛋白相互作用网络及"药材潜在活性成分作用靶点"相互作用网络;接着在DAVID和Reactome数据库中对潜在作用靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;最后,使用AutoDock Vina软件将潜在活性成分与核心靶点进行分子对接验证.结果:在葛花枳椇子中,共筛选出21个与疾病相关的潜在活性成分和431个潜在作用靶点,涉及蛋白结合、ATP结合等273种生物功能及磷脂酰肌醇3-激酶蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、TNF信号通路等90条KEGG代谢通路和信号转导、免疫系统等362条Reactome通路.分子对接结果显示,21个潜在活性成分与核心靶点蛋白激酶B(Akt)1、肿瘤蛋白p53(TP53)、IL-6均有较好的亲和力.结论:本研究结果揭示了葛花枳椇子治疗ALI的多成分、多靶点、多途径的作用特点