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目的 运用网络药理学的方法预测丹参对血小板聚集的主要活性成分、靶点及信号通路,探究其潜在的作用机制,以期开发新的抗血小板药物.方法 通过TCMSP数据库筛选丹参的有效成分;输入Pharm Mapper数据库获得相应基因;检索Gene-Cards数据库获得血小板聚集的靶点基因;利用R语言3.6.3截取交集网络获得候选靶点;借助Cytoscape 3.7.2将"药物-化合物-靶点-疾病"网络可视化处理;在String平台上构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络;利用DAVID数据库对候选靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路注释;潜在药效成分和关键靶点的分子对接由Autodock Vina 1.1.2实现.结果 获得丹参中65个活性化合物、109个不重复的靶标信息、84个血小板聚集治疗靶点.GO功能富集得到GO条目1963个(P<0.05),其中生物过程(BP)条目1789个,细胞组分(CC)条目113个,分子功能(MF)条目61个;KEGG通路富集得到129条信号通路(P<0.05).分子对接结果显示,丹参中的丹参酮ⅡA与G蛋白偶联受体(GPCRs)等靶点的亲和力强.结论 丹参中的有效成分作用血小板聚集的机制与磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B (PI3K/Akt)信号通路的调控有关,丹参通过介导磷酸腺苷(ADP)诱导的C信号通路对血小板聚集具有较好的整合效应.

作者:霍苏;崔鹤蓉;顾昱昊;戴子琦;王亚欣;娄邵岩;戚蕊;项嘉伟;王鹏龙;马涛;雷海民

来源:西北药学杂志 2021 年 36卷 4期

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作者:
霍苏;崔鹤蓉;顾昱昊;戴子琦;王亚欣;娄邵岩;戚蕊;项嘉伟;王鹏龙;马涛;雷海民
来源:
西北药学杂志 2021 年 36卷 4期
标签:
网络药理学 丹参 血小板聚集 作用机制 分子对接
目的 运用网络药理学的方法预测丹参对血小板聚集的主要活性成分、靶点及信号通路,探究其潜在的作用机制,以期开发新的抗血小板药物.方法 通过TCMSP数据库筛选丹参的有效成分;输入Pharm Mapper数据库获得相应基因;检索Gene-Cards数据库获得血小板聚集的靶点基因;利用R语言3.6.3截取交集网络获得候选靶点;借助Cytoscape 3.7.2将"药物-化合物-靶点-疾病"网络可视化处理;在String平台上构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络;利用DAVID数据库对候选靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路注释;潜在药效成分和关键靶点的分子对接由Autodock Vina 1.1.2实现.结果 获得丹参中65个活性化合物、109个不重复的靶标信息、84个血小板聚集治疗靶点.GO功能富集得到GO条目1963个(P<0.05),其中生物过程(BP)条目1789个,细胞组分(CC)条目113个,分子功能(MF)条目61个;KEGG通路富集得到129条信号通路(P<0.05).分子对接结果显示,丹参中的丹参酮ⅡA与G蛋白偶联受体(GPCRs)等靶点的亲和力强.结论 丹参中的有效成分作用血小板聚集的机制与磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B (PI3K/Akt)信号通路的调控有关,丹参通过介导磷酸腺苷(ADP)诱导的C信号通路对血小板聚集具有较好的整合效应.