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目的 基于网络药理学及分子对接技术探索羌活治疗心律失常的作用机制.方法 采用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)筛选羌活的有效成分及作用靶点;借助Genecards、OMIM数据获得心律失常疾病相关基因;应用STRING平台构建共同靶点蛋白互作网络(PPI);采用cytoscape 3.6.1软件构建药物-成分-靶点互作用网络,同时进行网络分析筛选分子对接的候选成分和靶点;通过cytoscape插件ClueGo对共同靶点进行GO(生物过程)富集分析,并应用R语言进行KEGG(京都基因与基因组百科全书)通路分析.最后,通过Autodock软件进行分子对接.结果 从TCMSP中获取羌活有效成分10种,有效靶点138个,从Genecards、OMIM数据库种获取心律失常相关基因2048个,构建共同靶点的PPI网络以及"药物-成分-靶点"网络,获得羌活治疗心律失常的关键潜在靶点26个,包含CASP、PTGS2、JUN等.这些靶点主要涉及循环系统中的血管过程、神经元死亡的正调控、磷脂C活性的正调控等生物学过程;通路富集显示,这些靶点与心律失常和其他多种疾病(如乙型肝炎、1型人体免疫缺陷病毒感染等)同时相关,此外,钙信号通路(Calcium signaling pathway)与对心律失常的发生、发展具有关键作用.分子对接结果显示羌活中的β-谷甾醇和印度榅桲素与关键靶点PTGS2、HSP90AA1结合能力较强,

作者:魏鹏路;邢文龙;李享;龙德怀;谭玉培;刘红旭

来源:世界中西医结合杂志 2022 年 17卷 3期

知识库介绍

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魏鹏路;邢文龙;李享;龙德怀;谭玉培;刘红旭
来源:
世界中西医结合杂志 2022 年 17卷 3期
标签:
羌活 心律失常 网络药理学 分子对接 作用机制 钙信号通路
目的 基于网络药理学及分子对接技术探索羌活治疗心律失常的作用机制.方法 采用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)筛选羌活的有效成分及作用靶点;借助Genecards、OMIM数据获得心律失常疾病相关基因;应用STRING平台构建共同靶点蛋白互作网络(PPI);采用cytoscape 3.6.1软件构建药物-成分-靶点互作用网络,同时进行网络分析筛选分子对接的候选成分和靶点;通过cytoscape插件ClueGo对共同靶点进行GO(生物过程)富集分析,并应用R语言进行KEGG(京都基因与基因组百科全书)通路分析.最后,通过Autodock软件进行分子对接.结果 从TCMSP中获取羌活有效成分10种,有效靶点138个,从Genecards、OMIM数据库种获取心律失常相关基因2048个,构建共同靶点的PPI网络以及"药物-成分-靶点"网络,获得羌活治疗心律失常的关键潜在靶点26个,包含CASP、PTGS2、JUN等.这些靶点主要涉及循环系统中的血管过程、神经元死亡的正调控、磷脂C活性的正调控等生物学过程;通路富集显示,这些靶点与心律失常和其他多种疾病(如乙型肝炎、1型人体免疫缺陷病毒感染等)同时相关,此外,钙信号通路(Calcium signaling pathway)与对心律失常的发生、发展具有关键作用.分子对接结果显示羌活中的β-谷甾醇和印度榅桲素与关键靶点PTGS2、HSP90AA1结合能力较强,