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目的 利用网络药理学和生物信息学方法对隐丹参酮(CTS)抗非小细胞肺癌(NSCLC)的机制进行较为全面的探讨.方法 以CTS为研究对象,使用TCMSP数据库、Swis-sTargetPrediction以及PharmMapper靶点预测平台收集CTS相关靶点;使用OMIM数据库、GeneCards数据库以及TCGA数据库收集NSCLC相关靶点;使用String数据库以及Cyto-scape软件构建交集靶点的PPI网络图,并筛选出核心靶点,用AutoDock Vina进行分子对接验证;运用R语言的cluster-Profiler包对交集靶点进行GO和KEGG富集分析;使用Cy-toscape软件构建"CTS-交集靶点-KEGG通路"网络.结果 得到交集靶点75个,主要涉及信号传导、磷酸化与去磷酸化、细胞凋亡与血管调节等多种生物过程,CTS主要通过胰腺癌、大肠癌、癌症途径、JAK-STAT信号通路、细胞凋亡以及自然杀伤细胞介导的细胞毒性等通路发挥其抗NSCLC作用.结论 CTS通过多靶点、多通路来发挥其抗NSCLC作用,为其进一步深入研究提供了理论上的支持.

作者:汤姝;吴占申;李纳;温强;康建;张晓坚

来源:中国药理学通报 2022 年 38卷 1期

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作者:
汤姝;吴占申;李纳;温强;康建;张晓坚
来源:
中国药理学通报 2022 年 38卷 1期
标签:
网络药理学;生物信息学;隐丹参酮;非小细胞肺癌;分子对接;作用机制
目的 利用网络药理学和生物信息学方法对隐丹参酮(CTS)抗非小细胞肺癌(NSCLC)的机制进行较为全面的探讨.方法 以CTS为研究对象,使用TCMSP数据库、Swis-sTargetPrediction以及PharmMapper靶点预测平台收集CTS相关靶点;使用OMIM数据库、GeneCards数据库以及TCGA数据库收集NSCLC相关靶点;使用String数据库以及Cyto-scape软件构建交集靶点的PPI网络图,并筛选出核心靶点,用AutoDock Vina进行分子对接验证;运用R语言的cluster-Profiler包对交集靶点进行GO和KEGG富集分析;使用Cy-toscape软件构建"CTS-交集靶点-KEGG通路"网络.结果 得到交集靶点75个,主要涉及信号传导、磷酸化与去磷酸化、细胞凋亡与血管调节等多种生物过程,CTS主要通过胰腺癌、大肠癌、癌症途径、JAK-STAT信号通路、细胞凋亡以及自然杀伤细胞介导的细胞毒性等通路发挥其抗NSCLC作用.结论 CTS通过多靶点、多通路来发挥其抗NSCLC作用,为其进一步深入研究提供了理论上的支持.