目的 探讨中华猕猴桃根治疗肝癌的潜在作用靶点及信号通路.方法 收集癌症基因组图谱数据库(TCGA)和国际癌症基因组联合体数据库(ICGC)截至2021年12月收录的肝癌患者肿瘤组织、正常肝组织的转录组数据及临床信息.代谢相关基因来自MSigDB数据库和Gene Cards数据库.筛选中华猕猴桃根的有效活性成分及靶点.利用R 4.1.1软件获得肝癌组织中差异表达的代谢基因.将差异代谢基因与中华猕猴桃根活性成分的靶基因做交集处理,获得交集基因.交集基因进行GO功能富集分析、KEGG通路富集分析.通过Cytoscape 3.9.0软件建立"中华猕猴桃根药效成分-靶点-疾病"的网络,获取节点的度值较大的靶点.利用vina软件进行分子对接,运用PyMOL软件对结合能的绝对值较大的对接结果进行可视化.结果 最终筛选出15种中华猕猴桃根有效成分化合物,涉及靶点基因326个.MSigDB数据库和Gene Cards数据库最终筛选出321个差异表达的代谢基因,与326个靶点基因进行交集映射,得到ACACA、ACSL4、AKR1C3、CYP1A2、CYP2C19等表达上调或下调的20个抗癌基因.药物活性成分-靶点网络构建结果显示,节点主要涉及槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇等13种活性成分,对应ACACA、ACSL4、AKR1C3、CYP1A2、CYP2C19、CYP2C9等20个潜在靶点.GO富集分析结果显示,其生物学过程主要在
作者：孙庆庆；陈晓泉；陈潞君；曲美霖；李京
来源：临床军医杂志 2022 年 50卷 7期
